More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2015 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 664 aa  1372    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3202  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.52 
 
 		 654 aa  772    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000159747  normal  0.0376991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  50.25 
 
 		 600 aa  634  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  45.48 
 
 		 596 aa  567  1e-160  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  44.55 
 
 		 619 aa  521  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  41.58 
 
 		 648 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  40.21 
 
 		 657 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  40.54 
 
 		 622 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.4 
 
 		 651 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1393  penicillin-binding protein 2, putative  37.5 
 
 		 621 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0265808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  37.9 
 
 		 640 aa  372  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  36.59 
 
 		 610 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  36.78 
 
 		 615 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  35.14 
 
 		 641 aa  346  7e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  34.36 
 
 		 646 aa  340  4e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  32.47 
 
 		 647 aa  333  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 		 643 aa  317  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 634 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.87 
 
 		 611 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.07 
 
 		 633 aa  270  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 		 646 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.34 
 
 		 647 aa  267  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.33 
 
 		 645 aa  266  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 643 aa  266  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  29.77 
 
 		 639 aa  264  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  29.75 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.16 
 
 		 636 aa  259  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  32.03 
 
 		 801 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  31.2 
 
 		 627 aa  258  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  30.85 
 
 		 681 aa  257  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 609 aa  256  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  29.51 
 
 		 662 aa  254  5.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 631 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 		 626 aa  253  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  29.47 
 
 		 664 aa  253  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 		 678 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  31.53 
 
 		 627 aa  252  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  30.97 
 
 		 610 aa  251  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.32 
 
 		 631 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  28.45 
 
 		 636 aa  250  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  30.55 
 
 		 602 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  30.55 
 
 		 602 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  31.46 
 
 		 801 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 618 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  31.55 
 
 		 801 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.94 
 
 		 642 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 630 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  31.45 
 
 		 766 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 		 630 aa  246  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 		 618 aa  246  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  30.61 
 
 		 618 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 		 618 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 		 618 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 		 618 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  31.8 
 
 		 803 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  32.01 
 
 		 802 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  32.01 
 
 		 802 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  32.01 
 
 		 802 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  29.84 
 
 		 643 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  32.01 
 
 		 802 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  30.29 
 
 		 618 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.66 
 
 		 629 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 		 637 aa  243  6e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  32.02 
 
 		 802 aa  243  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  31.8 
 
 		 809 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  31.8 
 
 		 803 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 		 618 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 628 aa  243  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 631 aa  243  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.74 
 
 		 673 aa  243  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 		 632 aa  243  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 		 618 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.37 
 
 		 646 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  28.59 
 
 		 691 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 793 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 		 634 aa  240  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  29.63 
 
 		 645 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  31.33 
 
 		 775 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 		 767 aa  239  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 646 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.19 
 
 		 771 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 		 610 aa  238  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 		 655 aa  238  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  29.84 
 
 		 629 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 		 602 aa  237  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 		 630 aa  238  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.5 
 
 		 629 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 683 aa  237  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 		 618 aa  237  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  29.31 
 
 		 630 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  29.42 
 
 		 631 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  29.29 
 
 		 703 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 		 640 aa  236  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 		 618 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 		 667 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  31.33 
 
 		 619 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  28.43 
 
 		 629 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>