More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0595 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 634 aa  1299    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  44.17 
 
 		 646 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  42.26 
 
 		 639 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  41.24 
 
 		 645 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  41.25 
 
 		 643 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  42.28 
 
 		 642 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  40.54 
 
 		 647 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  41.39 
 
 		 636 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  42.48 
 
 		 619 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  41.67 
 
 		 640 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  38.19 
 
 		 755 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.48 
 
 		 609 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  38.2 
 
 		 640 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  37.6 
 
 		 629 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  38.54 
 
 		 631 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  38.21 
 
 		 629 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  37.6 
 
 		 629 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  36.96 
 
 		 602 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  37.64 
 
 		 629 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  39.38 
 
 		 631 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  38.2 
 
 		 600 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  39.14 
 
 		 631 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  38.71 
 
 		 630 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  39.22 
 
 		 595 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  36.83 
 
 		 597 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  39.15 
 
 		 626 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  37.68 
 
 		 681 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  37.86 
 
 		 633 aa  381  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  36.98 
 
 		 610 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 		 671 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  36.42 
 
 		 640 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  38.08 
 
 		 630 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  36.48 
 
 		 645 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 		 648 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.04 
 
 		 618 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  35.36 
 
 		 618 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 		 637 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 		 618 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 		 618 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.33 
 
 		 640 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  37.73 
 
 		 646 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  36.41 
 
 		 629 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  37.12 
 
 		 663 aa  365  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 		 636 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  37.01 
 
 		 648 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  37.01 
 
 		 648 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  34.93 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  36.24 
 
 		 629 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  36.12 
 
 		 647 aa  365  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  34.93 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  34.93 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.93 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  36.66 
 
 		 648 aa  364  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  37.46 
 
 		 646 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  35.24 
 
 		 607 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  35.48 
 
 		 610 aa  362  8e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  37 
 
 		 631 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 		 667 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  37.44 
 
 		 630 aa  360  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 		 627 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 		 655 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 		 574 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  38.77 
 
 		 630 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 		 643 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  33.77 
 
 		 618 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 		 618 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  37.56 
 
 		 627 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 632 aa  355  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  38.35 
 
 		 586 aa  353  4e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 610 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  36.54 
 
 		 655 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  37.15 
 
 		 646 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  34.65 
 
 		 618 aa  352  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  35.4 
 
 		 612 aa  351  2e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  35.28 
 
 		 808 aa  351  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  34.69 
 
 		 646 aa  349  8e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  35.4 
 
 		 615 aa  349  9e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  35.54 
 
 		 800 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  36.51 
 
 		 803 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  35.51 
 
 		 602 aa  347  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 		 691 aa  347  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  35.51 
 
 		 602 aa  347  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  36.35 
 
 		 809 aa  347  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  36.35 
 
 		 803 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  36.32 
 
 		 649 aa  346  8e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 630 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  34.99 
 
 		 619 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 		 775 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  35.68 
 
 		 684 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 599 aa  345  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  35.68 
 
 		 684 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 		 678 aa  344  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  35.75 
 
 		 802 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  35.18 
 
 		 682 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  34.57 
 
 		 646 aa  343  4e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  36.41 
 
 		 802 aa  343  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  33.61 
 
 		 628 aa  343  7e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  36.41 
 
 		 802 aa  343  7e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>