More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1463 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
655 aa  1325    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  49.16 
 
 
661 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  49.77 
 
 
658 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  49.3 
 
 
646 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  39.79 
 
 
703 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  39.32 
 
 
625 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  35.5 
 
 
639 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 
643 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  36.92 
 
 
689 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.73 
 
 
761 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  34.43 
 
 
697 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  35.49 
 
 
646 aa  365  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 
636 aa  361  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.25 
 
 
642 aa  360  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 
634 aa  359  9e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  35.45 
 
 
640 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  35.84 
 
 
619 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 
645 aa  353  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  34.06 
 
 
647 aa  351  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 
609 aa  351  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 
709 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.08 
 
 
636 aa  336  7.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 
645 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  34.53 
 
 
613 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.42 
 
 
646 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 
671 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  31.84 
 
 
700 aa  325  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  35.83 
 
 
681 aa  324  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  34.56 
 
 
644 aa  321  3e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  33.08 
 
 
600 aa  319  7.999999999999999e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  33.13 
 
 
646 aa  317  5e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  34.77 
 
 
596 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  31.66 
 
 
800 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  35.01 
 
 
615 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  33.57 
 
 
701 aa  307  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  36.12 
 
 
697 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  34.31 
 
 
626 aa  306  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 
635 aa  306  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  31.13 
 
 
802 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  31.73 
 
 
612 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  31.73 
 
 
612 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  31.33 
 
 
809 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  31.33 
 
 
803 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  30.54 
 
 
801 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.2 
 
 
574 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  32.81 
 
 
647 aa  301  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  30.92 
 
 
669 aa  301  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 
764 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  34.32 
 
 
670 aa  300  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  31.19 
 
 
803 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 
761 aa  300  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.89 
 
 
640 aa  300  8e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  31.33 
 
 
802 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  31.33 
 
 
802 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  30.7 
 
 
635 aa  299  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  35.67 
 
 
605 aa  299  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  31.33 
 
 
802 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  31.33 
 
 
802 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  31.28 
 
 
760 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 
673 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.56 
 
 
767 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 
765 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 
765 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  33.18 
 
 
716 aa  298  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 
775 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  29.8 
 
 
628 aa  298  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  31.28 
 
 
756 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 
766 aa  296  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  29.66 
 
 
801 aa  296  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  29.66 
 
 
801 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  32.57 
 
 
610 aa  293  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  29.84 
 
 
793 aa  293  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.96 
 
 
771 aa  293  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 
764 aa  293  8e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 
643 aa  293  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 
610 aa  293  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 
703 aa  292  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 
643 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  31.54 
 
 
679 aa  291  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 
627 aa  291  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  32.32 
 
 
628 aa  289  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  32.62 
 
 
641 aa  289  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 
650 aa  289  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 
729 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  30.4 
 
 
637 aa  287  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  32.19 
 
 
627 aa  287  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 
618 aa  287  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 
724 aa  287  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 
597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  33.54 
 
 
634 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  29.8 
 
 
631 aa  283  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  30.07 
 
 
610 aa  283  9e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  31.24 
 
 
629 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  28.76 
 
 
652 aa  282  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  31.43 
 
 
612 aa  283  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 
618 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 
618 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  32.25 
 
 
667 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  31.42 
 
 
618 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>