More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3202 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3202  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 654 aa  1355    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000159747  normal  0.0376991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  62.52 
 
 		 664 aa  752    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  48.09 
 
 		 600 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  45.53 
 
 		 596 aa  536  1e-151  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  41.29 
 
 		 648 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  40.89 
 
 		 619 aa  460  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  37.89 
 
 		 657 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  38.1 
 
 		 622 aa  428  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.6 
 
 		 651 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1393  penicillin-binding protein 2, putative  37.56 
 
 		 621 aa  379  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0265808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  34.88 
 
 		 640 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  33.38 
 
 		 646 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  33.95 
 
 		 641 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  34.09 
 
 		 615 aa  309  8e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  33.01 
 
 		 647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  33.45 
 
 		 610 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.49 
 
 		 643 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 		 634 aa  280  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.04 
 
 		 645 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.27 
 
 		 633 aa  249  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  30.63 
 
 		 611 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.11 
 
 		 647 aa  249  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 636 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  31.17 
 
 		 650 aa  243  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  28.5 
 
 		 643 aa  243  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.11 
 
 		 678 aa  243  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 691 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 766 aa  240  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 		 648 aa  240  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  30.69 
 
 		 801 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 662 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  28.99 
 
 		 639 aa  238  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  30.85 
 
 		 655 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  30.13 
 
 		 664 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.3 
 
 		 628 aa  235  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 		 645 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  28.48 
 
 		 646 aa  234  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  29.36 
 
 		 802 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  28.87 
 
 		 803 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  28.84 
 
 		 809 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.24 
 
 		 574 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  28.87 
 
 		 803 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  30.85 
 
 		 801 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  31 
 
 		 801 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  31.18 
 
 		 673 aa  230  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 		 619 aa  230  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.21 
 
 		 642 aa  230  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  30.23 
 
 		 602 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  28.97 
 
 		 802 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  28.97 
 
 		 802 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  30.23 
 
 		 602 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  28.97 
 
 		 802 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  28.97 
 
 		 802 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  29.14 
 
 		 771 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 793 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  28.98 
 
 		 767 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  28.07 
 
 		 609 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  29.41 
 
 		 626 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  29.38 
 
 		 681 aa  225  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  29.25 
 
 		 800 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  27.99 
 
 		 640 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  28.59 
 
 		 756 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  28.62 
 
 		 636 aa  223  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  28.59 
 
 		 764 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  28.85 
 
 		 760 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 		 640 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  28.74 
 
 		 765 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  28.74 
 
 		 765 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 		 632 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  28.26 
 
 		 775 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  29.61 
 
 		 588 aa  220  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 703 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  29.77 
 
 		 683 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  29.09 
 
 		 761 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  28.85 
 
 		 627 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.98 
 
 		 618 aa  218  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  29.05 
 
 		 618 aa  217  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  27.44 
 
 		 619 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  29.05 
 
 		 618 aa  217  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.05 
 
 		 618 aa  217  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  27.83 
 
 		 648 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  27.83 
 
 		 648 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  30.26 
 
 		 630 aa  216  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  29.2 
 
 		 618 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  28.52 
 
 		 618 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  29.05 
 
 		 618 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  28.48 
 
 		 646 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  28.81 
 
 		 648 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  28.79 
 
 		 646 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.34 
 
 		 641 aa  215  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  28.62 
 
 		 637 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 		 630 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  27.77 
 
 		 618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  27.77 
 
 		 618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  27.77 
 
 		 618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  27.77 
 
 		 618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 		 631 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 		 646 aa  214  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  30.1 
 
 		 646 aa  213  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 		 691 aa  213  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>