More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1000 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  60.71 
 
 		 647 aa  810    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  93.06 
 
 		 648 aa  1228    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 648 aa  1315    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  57.66 
 
 		 649 aa  754    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  63.64 
 
 		 648 aa  832    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 648 aa  1315    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  60.96 
 
 		 647 aa  827    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  47.1 
 
 		 628 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  48.88 
 
 		 681 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  47.35 
 
 		 624 aa  560  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  46.45 
 
 		 662 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  44.83 
 
 		 634 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  42.28 
 
 		 689 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 		 639 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  42.95 
 
 		 636 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  42.95 
 
 		 658 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  40.89 
 
 		 630 aa  435  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  39.74 
 
 		 634 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  40.2 
 
 		 631 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  40.89 
 
 		 646 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  39.54 
 
 		 629 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  42.7 
 
 		 670 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  39.54 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  39.54 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  40.92 
 
 		 646 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  40.03 
 
 		 631 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  40.03 
 
 		 631 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  38.51 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  39.21 
 
 		 629 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  39.86 
 
 		 626 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  37.97 
 
 		 619 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  38.79 
 
 		 647 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  40.66 
 
 		 619 aa  405  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 		 618 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  38.97 
 
 		 643 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  38.29 
 
 		 645 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  39.27 
 
 		 646 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  37.1 
 
 		 627 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 		 609 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  38.19 
 
 		 642 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  37.38 
 
 		 610 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  37.34 
 
 		 639 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  37.62 
 
 		 629 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  39.93 
 
 		 655 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 		 618 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 		 618 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  37.09 
 
 		 618 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  37.09 
 
 		 618 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  40.03 
 
 		 627 aa  395  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  37.67 
 
 		 636 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.9 
 
 		 618 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  36.83 
 
 		 629 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  39.67 
 
 		 630 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  36.56 
 
 		 618 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  38.21 
 
 		 630 aa  392  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  39.44 
 
 		 631 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  39.5 
 
 		 667 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  36.99 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.74 
 
 		 640 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  36.5 
 
 		 634 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  37.57 
 
 		 640 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  37.99 
 
 		 678 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  36.99 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 		 637 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  36.99 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  35.03 
 
 		 628 aa  388  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  36.87 
 
 		 636 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  36.99 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  37.09 
 
 		 611 aa  385  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  37.44 
 
 		 630 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 		 662 aa  383  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  35.26 
 
 		 610 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 		 664 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  35.83 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  35.83 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  35.83 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  38.31 
 
 		 636 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  35.83 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  37.01 
 
 		 634 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  38.08 
 
 		 687 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  37.95 
 
 		 687 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  35.83 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  35.83 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  35.83 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  35.83 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  35.83 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  35.4 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  35.4 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  35.4 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  35.4 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 		 643 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  35.4 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  35.66 
 
 		 631 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  39.21 
 
 		 630 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  35.48 
 
 		 634 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  37.65 
 
 		 646 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  35.46 
 
 		 633 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  35.87 
 
 		 626 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  35.45 
 
 		 638 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 		 618 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>