More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00580 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  60.78 
 
 		 657 aa  777    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  58.2 
 
 		 619 aa  746    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 622 aa  1282    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1393  penicillin-binding protein 2, putative  41.33 
 
 		 621 aa  469  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0265808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.76 
 
 		 651 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  41.67 
 
 		 600 aa  467  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  40.54 
 
 		 664 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  41.69 
 
 		 648 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  40.39 
 
 		 596 aa  457  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3202  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 		 654 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000159747  normal  0.0376991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  34.8 
 
 		 639 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  36.03 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  35.31 
 
 		 640 aa  333  4e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 		 643 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  34.75 
 
 		 610 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  35.05 
 
 		 641 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  34.05 
 
 		 646 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  32.88 
 
 		 645 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.77 
 
 		 647 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  32.64 
 
 		 636 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  33.67 
 
 		 647 aa  299  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 		 642 aa  299  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 		 643 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 		 627 aa  291  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 634 aa  290  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  33.1 
 
 		 640 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 		 646 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.09 
 
 		 611 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 		 633 aa  273  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 		 630 aa  272  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 		 618 aa  270  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 662 aa  267  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 691 aa  266  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 		 618 aa  266  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 664 aa  266  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  31.86 
 
 		 612 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  31.86 
 
 		 615 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 618 aa  264  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.2 
 
 		 632 aa  263  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  31.12 
 
 		 610 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.75 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 		 634 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 610 aa  260  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.29 
 
 		 574 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  31.54 
 
 		 646 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 		 643 aa  257  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  29.79 
 
 		 628 aa  257  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 		 646 aa  256  9e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 		 630 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  30.71 
 
 		 626 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 		 618 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.17 
 
 		 678 aa  254  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  30.44 
 
 		 626 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  31.97 
 
 		 618 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.86 
 
 		 631 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  31.32 
 
 		 646 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  31.24 
 
 		 619 aa  251  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 		 630 aa  250  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  31.21 
 
 		 627 aa  249  9e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.15 
 
 		 629 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 629 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  30.21 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.98 
 
 		 629 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 		 618 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 		 618 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  29.95 
 
 		 618 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 631 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 631 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.24 
 
 		 681 aa  246  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  30.74 
 
 		 661 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.62 
 
 		 629 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.79 
 
 		 771 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 645 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  30.39 
 
 		 617 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 		 619 aa  243  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  30.39 
 
 		 617 aa  243  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  31.27 
 
 		 800 aa  243  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  29.31 
 
 		 703 aa  243  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  31.4 
 
 		 766 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  31.44 
 
 		 673 aa  242  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 		 630 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 		 767 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 		 640 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  30.17 
 
 		 637 aa  241  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 		 648 aa  240  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  27.93 
 
 		 629 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 		 793 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  30.31 
 
 		 652 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 		 650 aa  239  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  29.59 
 
 		 638 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  28.82 
 
 		 602 aa  237  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  28.82 
 
 		 602 aa  237  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  28.44 
 
 		 629 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  31.14 
 
 		 802 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>