More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3305 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 600 aa  1238    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  50.25 
 
 		 664 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  50.34 
 
 		 596 aa  600  1e-170  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3202  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.09 
 
 		 654 aa  575  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000159747  normal  0.0376991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  46.07 
 
 		 657 aa  505  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  43.1 
 
 		 648 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  44.37 
 
 		 619 aa  495  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1393  penicillin-binding protein 2, putative  42.47 
 
 		 621 aa  478  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0265808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  41.67 
 
 		 622 aa  467  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.32 
 
 		 651 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  36.09 
 
 		 640 aa  350  6e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  36.22 
 
 		 615 aa  337  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  34.51 
 
 		 610 aa  330  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  34.56 
 
 		 646 aa  329  8e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  35.14 
 
 		 641 aa  320  6e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 		 647 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 		 643 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 		 634 aa  297  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.36 
 
 		 639 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 		 643 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  33.23 
 
 		 801 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.69 
 
 		 645 aa  256  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 		 642 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  28.59 
 
 		 647 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 		 766 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 		 633 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 		 793 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 		 609 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  30.26 
 
 		 630 aa  250  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  30.98 
 
 		 662 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 		 636 aa  248  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  30.13 
 
 		 630 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 		 636 aa  246  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 		 631 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  30.54 
 
 		 619 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 		 678 aa  243  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  28.48 
 
 		 611 aa  242  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  28.47 
 
 		 596 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  28.9 
 
 		 655 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  30.11 
 
 		 602 aa  241  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  30.11 
 
 		 602 aa  241  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 		 646 aa  241  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 664 aa  240  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 630 aa  239  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  31.42 
 
 		 574 aa  239  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.29 
 
 		 631 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  31.3 
 
 		 646 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  31.63 
 
 		 646 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  32.29 
 
 		 801 aa  237  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  31.08 
 
 		 802 aa  236  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 631 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 		 632 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 645 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.6 
 
 		 771 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  31.5 
 
 		 800 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  31.97 
 
 		 801 aa  234  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 		 618 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 		 618 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  30.93 
 
 		 809 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  30.93 
 
 		 803 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 		 618 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  31.01 
 
 		 618 aa  233  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.8 
 
 		 629 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  29.35 
 
 		 661 aa  232  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.8 
 
 		 629 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  29.94 
 
 		 629 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  30.97 
 
 		 802 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  30.97 
 
 		 802 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 		 629 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  30.97 
 
 		 802 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 765 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  30.97 
 
 		 802 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  31.01 
 
 		 775 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 765 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  30.97 
 
 		 760 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 650 aa  231  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 		 618 aa  231  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  29.87 
 
 		 610 aa  230  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.19 
 
 		 618 aa  230  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  30.77 
 
 		 803 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  32.06 
 
 		 635 aa  229  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  29.35 
 
 		 640 aa  229  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 		 767 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 761 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  29.47 
 
 		 597 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 764 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 		 756 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  30.4 
 
 		 618 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  28.46 
 
 		 637 aa  228  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 		 691 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 		 683 aa  228  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  29.35 
 
 		 586 aa  227  6e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 634 aa  226  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  29.21 
 
 		 629 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  30.24 
 
 		 679 aa  226  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  28.88 
 
 		 646 aa  226  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 		 618 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 		 635 aa  226  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 		 618 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 		 618 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>