More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1537 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  52.33 
 
 
658 aa  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
646 aa  1318    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  47.83 
 
 
661 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  49.3 
 
 
655 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  40.24 
 
 
689 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  39.51 
 
 
643 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  40 
 
 
639 aa  435  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  38.48 
 
 
703 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  38.49 
 
 
636 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  38.26 
 
 
647 aa  412  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  37.98 
 
 
697 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  36.72 
 
 
645 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.72 
 
 
761 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 
634 aa  364  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  36.16 
 
 
609 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  37.93 
 
 
640 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  38.37 
 
 
670 aa  353  7e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  39.75 
 
 
709 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 
671 aa  349  9e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  34.16 
 
 
625 aa  346  8e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  37.98 
 
 
701 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  34.26 
 
 
626 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  35.45 
 
 
697 aa  342  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
610 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  36.18 
 
 
605 aa  335  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  31.8 
 
 
574 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  34.57 
 
 
600 aa  330  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 
636 aa  330  6e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  37.13 
 
 
764 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  32.99 
 
 
667 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  34.45 
 
 
644 aa  320  6e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.23 
 
 
646 aa  318  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 
618 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 
646 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 
633 aa  317  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  34.26 
 
 
716 aa  316  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  33.07 
 
 
611 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.92 
 
 
586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
610 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
596 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  39.45 
 
 
642 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  33.69 
 
 
648 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 
628 aa  310  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  32.49 
 
 
809 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  32.59 
 
 
803 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 
600 aa  308  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  33.64 
 
 
681 aa  306  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  32.64 
 
 
802 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  31.89 
 
 
800 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
686 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  32.44 
 
 
802 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  32.44 
 
 
802 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  32.44 
 
 
802 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 
729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  32.34 
 
 
803 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  32.44 
 
 
802 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  33.28 
 
 
647 aa  303  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  33.03 
 
 
627 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
662 aa  303  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  37.84 
 
 
700 aa  302  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  32.71 
 
 
613 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 
635 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 
673 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  33.64 
 
 
597 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.06 
 
 
629 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  33.23 
 
 
648 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  33.23 
 
 
648 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  31.35 
 
 
801 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
602 aa  299  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  31.6 
 
 
629 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 
703 aa  299  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 
793 aa  299  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  31.76 
 
 
629 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 
766 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 
630 aa  298  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 
629 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 
767 aa  297  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 
631 aa  297  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  29.97 
 
 
652 aa  296  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  39.44 
 
 
646 aa  296  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  30.96 
 
 
637 aa  296  9e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 
689 aa  296  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  32.72 
 
 
615 aa  295  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  30.98 
 
 
557 aa  295  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 
683 aa  295  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 
650 aa  295  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  41.96 
 
 
619 aa  294  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 
557 aa  295  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  31.54 
 
 
586 aa  293  6e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 
771 aa  293  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  31.52 
 
 
617 aa  293  7e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  32.07 
 
 
602 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 
631 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  32.07 
 
 
602 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 
603 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  33.48 
 
 
724 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 
643 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  32.14 
 
 
631 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>