More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3359 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  55.73 
 
 		 600 aa  636    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  53.69 
 
 		 602 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 597 aa  1222    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  54.42 
 
 		 755 aa  648    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  53.58 
 
 		 595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  49.49 
 
 		 640 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  41.24 
 
 		 647 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  40.03 
 
 		 645 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  39.69 
 
 		 639 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  39.37 
 
 		 636 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  39.01 
 
 		 643 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  38.87 
 
 		 642 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  40.18 
 
 		 640 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 		 646 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 		 609 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  36.88 
 
 		 634 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  39.3 
 
 		 611 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  36.2 
 
 		 619 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  38.28 
 
 		 681 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  36.86 
 
 		 636 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  34.08 
 
 		 574 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 		 645 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  36.44 
 
 		 681 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  36.76 
 
 		 630 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  35.88 
 
 		 619 aa  350  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  35.84 
 
 		 628 aa  349  6e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  36.68 
 
 		 646 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  36.87 
 
 		 643 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 		 618 aa  347  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 		 618 aa  347  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 		 618 aa  346  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  38.1 
 
 		 586 aa  346  6e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  36.12 
 
 		 627 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  36.49 
 
 		 647 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  35.23 
 
 		 618 aa  342  8e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  36.95 
 
 		 629 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  35.47 
 
 		 801 aa  342  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  36.04 
 
 		 637 aa  342  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 631 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  34.84 
 
 		 637 aa  341  2.9999999999999998e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  37.15 
 
 		 646 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  37.07 
 
 		 629 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 629 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  35.24 
 
 		 618 aa  339  7e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 618 aa  339  8e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  34.42 
 
 		 664 aa  339  9e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  36.9 
 
 		 629 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 		 662 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  37.85 
 
 		 631 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 		 678 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 		 601 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 		 618 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 		 618 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  34.45 
 
 		 618 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 		 648 aa  337  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 		 618 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  34.9 
 
 		 602 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  33.04 
 
 		 599 aa  336  5.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  34.9 
 
 		 602 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  34.58 
 
 		 648 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  34.58 
 
 		 648 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 648 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  33.56 
 
 		 638 aa  336  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  37.39 
 
 		 630 aa  336  9e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 		 618 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  37.5 
 
 		 646 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 		 631 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  35.24 
 
 		 610 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 		 618 aa  334  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  33.69 
 
 		 624 aa  333  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  32.87 
 
 		 601 aa  333  6e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  35.73 
 
 		 629 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  35.68 
 
 		 630 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  35.69 
 
 		 673 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  35.92 
 
 		 640 aa  331  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  34.16 
 
 		 638 aa  331  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.21 
 
 		 633 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  35.52 
 
 		 630 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 641 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  36.32 
 
 		 627 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  36.82 
 
 		 617 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  33.61 
 
 		 632 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  35.34 
 
 		 679 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  35.84 
 
 		 629 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  33.05 
 
 		 628 aa  327  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  36.82 
 
 		 617 aa  327  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  34.87 
 
 		 766 aa  327  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  32.92 
 
 		 588 aa  327  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 618 aa  326  7e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  35.03 
 
 		 801 aa  326  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  34.95 
 
 		 634 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  34.87 
 
 		 801 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  35.06 
 
 		 793 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 		 630 aa  324  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 		 618 aa  324  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  36.81 
 
 		 649 aa  323  5e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  33.51 
 
 		 615 aa  323  6e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  34.63 
 
 		 662 aa  323  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  33.68 
 
 		 612 aa  323  7e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 		 632 aa  322  9.000000000000001e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>