More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2014 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
624 aa  1270    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  48.84 
 
 
628 aa  555  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  47.35 
 
 
648 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  47.35 
 
 
648 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  48.76 
 
 
648 aa  551  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  46.55 
 
 
648 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  45.68 
 
 
681 aa  531  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  47.11 
 
 
647 aa  528  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  47.17 
 
 
647 aa  528  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  44.98 
 
 
634 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  46.29 
 
 
670 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  45.84 
 
 
658 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  44.68 
 
 
662 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  45.13 
 
 
649 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  42.45 
 
 
689 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  42.86 
 
 
636 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  40.88 
 
 
639 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  37.99 
 
 
636 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  40.11 
 
 
609 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  39.46 
 
 
634 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  37.18 
 
 
640 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  39.73 
 
 
619 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 
642 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  37.1 
 
 
639 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  35.3 
 
 
643 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  38.37 
 
 
626 aa  379  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  37.1 
 
 
647 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  36.7 
 
 
645 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  37.8 
 
 
640 aa  369  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  39.97 
 
 
633 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  37.4 
 
 
629 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.88 
 
 
618 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  38.3 
 
 
631 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 
630 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  37.21 
 
 
646 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  37.22 
 
 
626 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  37.4 
 
 
629 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  38.94 
 
 
630 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  38.66 
 
 
631 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  37.56 
 
 
629 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  37.87 
 
 
611 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  38.83 
 
 
631 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  37.03 
 
 
629 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  35.71 
 
 
634 aa  353  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  36.56 
 
 
646 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  34.98 
 
 
625 aa  347  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  35.35 
 
 
631 aa  347  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  37.26 
 
 
619 aa  346  7e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 
618 aa  346  8e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  35.35 
 
 
634 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  34.75 
 
 
634 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.26 
 
 
641 aa  343  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  35.88 
 
 
637 aa  342  9e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 
629 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  37.38 
 
 
627 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  35.3 
 
 
636 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  34.67 
 
 
633 aa  339  7e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  35.6 
 
 
640 aa  339  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  33.95 
 
 
628 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  37.96 
 
 
629 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.62 
 
 
640 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  35.01 
 
 
633 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 
646 aa  337  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  35.01 
 
 
633 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  35.01 
 
 
633 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  35.01 
 
 
633 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  35.01 
 
 
633 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  35.01 
 
 
633 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  35.01 
 
 
633 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  35.01 
 
 
633 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  34.09 
 
 
631 aa  336  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  35.01 
 
 
633 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  34.78 
 
 
638 aa  336  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  34.09 
 
 
631 aa  336  7.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 
632 aa  336  7.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  34.3 
 
 
633 aa  336  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  34.3 
 
 
633 aa  336  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  34.3 
 
 
633 aa  336  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  34.3 
 
 
633 aa  336  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  34.3 
 
 
633 aa  336  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  36.39 
 
 
630 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  33.49 
 
 
632 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 
610 aa  335  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  35.63 
 
 
627 aa  334  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  33.93 
 
 
631 aa  334  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  36.74 
 
 
630 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 
645 aa  333  8e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  37.3 
 
 
655 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 
618 aa  330  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 
634 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  33.87 
 
 
597 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 
618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 
618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  35.08 
 
 
618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 
618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 
602 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 
618 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  34.59 
 
 
618 aa  327  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 
618 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 
618 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>