More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0592 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  60.19 
 
 		 648 aa  794    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  60.71 
 
 		 648 aa  799    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  60.71 
 
 		 648 aa  799    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  58.52 
 
 		 649 aa  733    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  63.88 
 
 		 648 aa  840    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  57.5 
 
 		 647 aa  778    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  100 
 
 		 647 aa  1309    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  49.42 
 
 		 628 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  51.02 
 
 		 681 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  47.11 
 
 		 624 aa  528  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  45.92 
 
 		 662 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  43.29 
 
 		 634 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  43.78 
 
 		 689 aa  497  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  44.31 
 
 		 658 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  41.13 
 
 		 639 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  44.22 
 
 		 670 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  41.46 
 
 		 636 aa  438  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  39.5 
 
 		 634 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  40.33 
 
 		 646 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  40.59 
 
 		 630 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  40.33 
 
 		 646 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  40 
 
 		 631 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  38.94 
 
 		 629 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  39.67 
 
 		 631 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  38.78 
 
 		 629 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  38.94 
 
 		 629 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  38.94 
 
 		 629 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.93 
 
 		 640 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  39.04 
 
 		 631 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  38.47 
 
 		 619 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.15 
 
 		 618 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  39.35 
 
 		 630 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  38.82 
 
 		 632 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  39.49 
 
 		 626 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  39.34 
 
 		 630 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  38.52 
 
 		 630 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  40.17 
 
 		 619 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.62 
 
 		 609 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  37.7 
 
 		 634 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  38.6 
 
 		 633 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  36.29 
 
 		 610 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  38.61 
 
 		 631 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.45 
 
 		 667 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  38.17 
 
 		 611 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  35.97 
 
 		 618 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  38.88 
 
 		 655 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  37.58 
 
 		 629 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  36.17 
 
 		 627 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  36.24 
 
 		 618 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  36.24 
 
 		 618 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  35.54 
 
 		 638 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  36.08 
 
 		 618 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  36.94 
 
 		 629 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  37.85 
 
 		 626 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  36.24 
 
 		 618 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  37.02 
 
 		 639 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  36.29 
 
 		 636 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  36.08 
 
 		 618 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  36.08 
 
 		 618 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  36.08 
 
 		 618 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  35.26 
 
 		 643 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  36.08 
 
 		 618 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 		 618 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  37.59 
 
 		 642 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  37.76 
 
 		 643 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  35.68 
 
 		 618 aa  379  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 		 618 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  34.63 
 
 		 633 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 633 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 633 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 		 646 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 633 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  36.56 
 
 		 627 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  34.63 
 
 		 633 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 633 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 633 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.06 
 
 		 641 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 633 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  34.19 
 
 		 633 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  39.04 
 
 		 687 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  34.19 
 
 		 633 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  34.19 
 
 		 633 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  34.19 
 
 		 633 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 633 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  35.09 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  34.19 
 
 		 633 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  39.04 
 
 		 687 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  37.45 
 
 		 640 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  36.03 
 
 		 646 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  36.99 
 
 		 636 aa  369  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  35.11 
 
 		 637 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  35.07 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  34.94 
 
 		 637 aa  368  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  33.87 
 
 		 652 aa  365  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  34.42 
 
 		 634 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  36.12 
 
 		 634 aa  365  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 618 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  34.04 
 
 		 623 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>