More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0178 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
588 aa  1201    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  48.79 
 
 
625 aa  556  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  35.19 
 
 
574 aa  353  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.5 
 
 
639 aa  345  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
643 aa  339  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  34.55 
 
 
645 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  34.61 
 
 
647 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  33.45 
 
 
597 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 
645 aa  332  9e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  33.79 
 
 
636 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.88 
 
 
636 aa  323  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  31.69 
 
 
640 aa  319  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  31.83 
 
 
600 aa  316  7e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  29.93 
 
 
755 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  32.69 
 
 
619 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
646 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.87 
 
 
586 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 
642 aa  310  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  32.92 
 
 
640 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  33.45 
 
 
608 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.67 
 
 
640 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  35.36 
 
 
608 aa  307  4.0000000000000004e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 
671 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0670  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 
607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.265055  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 
662 aa  302  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.02 
 
 
681 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  32.39 
 
 
664 aa  299  8e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 
635 aa  299  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1995  penicillin-binding protein 2  33.1 
 
 
607 aa  298  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  32.47 
 
 
610 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  31.99 
 
 
637 aa  296  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 
595 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
691 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 
634 aa  293  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
605 aa  293  6e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 
602 aa  293  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  32.89 
 
 
678 aa  292  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 
646 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 
609 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1182  penicillin-binding protein 2  32.86 
 
 
602 aa  290  4e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0450  penicillin-binding protein 2  33.04 
 
 
609 aa  289  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  30.5 
 
 
646 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 
703 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  33.94 
 
 
682 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  32.76 
 
 
647 aa  286  9e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  29.29 
 
 
646 aa  286  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
684 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
684 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  31.48 
 
 
803 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 
596 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  31.48 
 
 
809 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  31.48 
 
 
803 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  30.65 
 
 
801 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  31.61 
 
 
802 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  32.82 
 
 
601 aa  283  6.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  32.82 
 
 
599 aa  282  1e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  31.18 
 
 
612 aa  282  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  31.19 
 
 
631 aa  282  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  30.49 
 
 
801 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  30.02 
 
 
602 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  31.31 
 
 
634 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  30.02 
 
 
602 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  31.37 
 
 
802 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  33.27 
 
 
617 aa  281  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  31.37 
 
 
802 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  31.37 
 
 
802 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  31.37 
 
 
802 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  31.27 
 
 
641 aa  280  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
766 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  31.01 
 
 
615 aa  280  4e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 
662 aa  280  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  32.29 
 
 
599 aa  279  9e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  30.85 
 
 
633 aa  279  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  32.64 
 
 
601 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 
610 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  30.89 
 
 
760 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 
765 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 
765 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  29.9 
 
 
801 aa  277  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  30.55 
 
 
635 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  31.9 
 
 
600 aa  276  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 
628 aa  276  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 
643 aa  276  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  30.98 
 
 
633 aa  276  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  31.33 
 
 
764 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1073  peptidoglycan glycosyltransferase  32.99 
 
 
604 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 
673 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 
793 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  30.81 
 
 
633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  30.81 
 
 
633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  30.81 
 
 
633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  30.49 
 
 
634 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  30.81 
 
 
633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  30.81 
 
 
633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  32.54 
 
 
627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  30.81 
 
 
633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  30.89 
 
 
756 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  30.81 
 
 
633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  30.81 
 
 
633 aa  274  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  30.37 
 
 
613 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>