More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0309 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  54.14 
 
 		 599 aa  650    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0670  penicillin-binding protein 2  51.75 
 
 		 607 aa  641    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.265055  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  53.59 
 
 		 601 aa  649    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  56.38 
 
 		 608 aa  703    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0450  penicillin-binding protein 2  55.74 
 
 		 609 aa  691    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  53.76 
 
 		 601 aa  650    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1182  penicillin-binding protein 2  55.57 
 
 		 602 aa  691    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 608 aa  1247    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1995  penicillin-binding protein 2  56.18 
 
 		 607 aa  694    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1073  peptidoglycan glycosyltransferase  50.76 
 
 		 604 aa  598  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 648 aa  350  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  34.98 
 
 		 634 aa  348  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  34.9 
 
 		 631 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  34.79 
 
 		 648 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 		 648 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 		 648 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  34.66 
 
 		 634 aa  340  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  33.56 
 
 		 755 aa  339  8e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  33.81 
 
 		 636 aa  336  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  32.03 
 
 		 647 aa  336  9e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 		 633 aa  333  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  34.38 
 
 		 634 aa  333  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 		 633 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 		 633 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 		 633 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 		 633 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 		 633 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 		 631 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 		 631 aa  331  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 		 631 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  32.44 
 
 		 640 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  33.9 
 
 		 662 aa  327  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 		 645 aa  326  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  32.31 
 
 		 633 aa  324  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 		 628 aa  324  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  32.31 
 
 		 633 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  32.31 
 
 		 633 aa  323  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  32.31 
 
 		 633 aa  323  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  32.31 
 
 		 633 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  32.31 
 
 		 633 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 		 602 aa  323  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  32.31 
 
 		 633 aa  323  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  32.31 
 
 		 633 aa  323  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  32.47 
 
 		 633 aa  323  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  33.12 
 
 		 681 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  33.1 
 
 		 611 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  35.36 
 
 		 627 aa  321  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 		 632 aa  321  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 		 618 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 618 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  33.05 
 
 		 597 aa  317  6e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 		 641 aa  316  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 		 595 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  33.55 
 
 		 610 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  35.25 
 
 		 588 aa  313  6.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  34.02 
 
 		 621 aa  312  9e-84  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  32.53 
 
 		 689 aa  312  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 		 630 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  33.89 
 
 		 627 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 		 618 aa  310  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  32.16 
 
 		 600 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.15 
 
 		 641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.53 
 
 		 586 aa  307  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 		 647 aa  307  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 		 678 aa  306  6e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  31.85 
 
 		 638 aa  306  7e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.32 
 
 		 574 aa  306  8.000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  32.67 
 
 		 623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 		 618 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  32.26 
 
 		 628 aa  306  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  32.31 
 
 		 626 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  33.11 
 
 		 629 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  33.11 
 
 		 629 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  32.46 
 
 		 623 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 		 629 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 		 618 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 		 618 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  32.46 
 
 		 623 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  30.55 
 
 		 634 aa  304  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 		 618 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  32.5 
 
 		 623 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 		 703 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  32.5 
 
 		 623 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  32.94 
 
 		 629 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 		 633 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 		 639 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 		 646 aa  301  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 		 640 aa  300  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  31.3 
 
 		 618 aa  300  7e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  32.25 
 
 		 637 aa  300  7e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 		 631 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 643 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  31.96 
 
 		 632 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 618 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.73 
 
 		 645 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 618 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 618 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 630 aa  298  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  31.49 
 
 		 618 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 		 607 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>