More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1995 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1995  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
607 aa  1262    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  55.5 
 
 
599 aa  681    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0670  penicillin-binding protein 2  54.61 
 
 
607 aa  670    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.265055  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  55.48 
 
 
601 aa  686    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0450  penicillin-binding protein 2  85.67 
 
 
609 aa  1080    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  55.48 
 
 
601 aa  683    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1182  penicillin-binding protein 2  60.86 
 
 
602 aa  763    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  58.56 
 
 
608 aa  746    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  56.34 
 
 
608 aa  693    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1073  peptidoglycan glycosyltransferase  50.33 
 
 
604 aa  600  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  33.9 
 
 
755 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 
681 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 
633 aa  334  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 
662 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
634 aa  330  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.12 
 
 
645 aa  329  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  34.2 
 
 
629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  33.76 
 
 
637 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  33.88 
 
 
629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 
629 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  33.87 
 
 
629 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  32.77 
 
 
643 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  32.66 
 
 
640 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  34.15 
 
 
611 aa  323  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 
597 aa  323  5e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 
602 aa  323  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
631 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  32.88 
 
 
647 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 
607 aa  321  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 
648 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 
645 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 
633 aa  320  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  32.3 
 
 
633 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 
633 aa  320  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  32.3 
 
 
633 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 
633 aa  320  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  32.43 
 
 
628 aa  320  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 
633 aa  320  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 
633 aa  320  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
609 aa  320  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 
633 aa  320  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  33.89 
 
 
630 aa  320  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 
631 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 
689 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.73 
 
 
647 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  32.13 
 
 
633 aa  318  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  32.08 
 
 
628 aa  317  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.84 
 
 
574 aa  316  6e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  32.57 
 
 
636 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  34.07 
 
 
646 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 
631 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.28 
 
 
639 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 
618 aa  312  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  32.9 
 
 
627 aa  312  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 
595 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 
648 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 
648 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  31.87 
 
 
634 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  33.45 
 
 
646 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  33.77 
 
 
631 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 
641 aa  311  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 
618 aa  310  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  32.76 
 
 
634 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  33.72 
 
 
618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 
618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 
618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 
646 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  31.54 
 
 
634 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 
627 aa  307  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 
631 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 
631 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.24 
 
 
586 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  32.83 
 
 
618 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  32.14 
 
 
631 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  31.86 
 
 
638 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 
632 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
664 aa  303  8.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  32.71 
 
 
626 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 
636 aa  302  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
662 aa  302  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  32.32 
 
 
629 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  33.56 
 
 
588 aa  299  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  29.27 
 
 
648 aa  299  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 
634 aa  298  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  33.1 
 
 
621 aa  298  2e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  31.7 
 
 
618 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  31.9 
 
 
602 aa  297  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  31.9 
 
 
602 aa  297  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 
618 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 
618 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 
618 aa  298  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 
618 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  32.32 
 
 
623 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 
629 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 
640 aa  296  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>