More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0670 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1995  penicillin-binding protein 2  54.61 
 
 
607 aa  672    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0450  penicillin-binding protein 2  55.09 
 
 
609 aa  679    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  53.59 
 
 
599 aa  644    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0670  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
607 aa  1253    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.265055  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  55.78 
 
 
608 aa  695    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  52.08 
 
 
608 aa  645    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  53.65 
 
 
601 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  53.65 
 
 
601 aa  648    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1182  penicillin-binding protein 2  55.2 
 
 
602 aa  671    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1073  peptidoglycan glycosyltransferase  49.84 
 
 
604 aa  617  1e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  36.45 
 
 
645 aa  364  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  33.83 
 
 
755 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  33.87 
 
 
641 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  34.16 
 
 
631 aa  344  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  34.97 
 
 
633 aa  339  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  34.01 
 
 
634 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
643 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  33.78 
 
 
640 aa  334  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 
633 aa  334  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 
633 aa  334  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  33.84 
 
 
633 aa  333  6e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 
633 aa  333  6e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 
633 aa  333  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 
633 aa  333  6e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 
633 aa  333  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 
633 aa  333  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  33.84 
 
 
633 aa  333  6e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  33.89 
 
 
633 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  33.89 
 
 
633 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  33.89 
 
 
633 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  33.89 
 
 
633 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  33.89 
 
 
633 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  34.18 
 
 
628 aa  332  9e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 
623 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 
623 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 
623 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 
623 aa  330  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  32.83 
 
 
634 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 
623 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  33.97 
 
 
595 aa  327  5e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  33.67 
 
 
647 aa  326  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  32.83 
 
 
597 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
626 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 
607 aa  324  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  32.33 
 
 
634 aa  325  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 
662 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 
631 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.55 
 
 
639 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  34.85 
 
 
617 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.53 
 
 
645 aa  323  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 
678 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  33.06 
 
 
631 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  33.66 
 
 
681 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  33.06 
 
 
631 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 
648 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  34.18 
 
 
617 aa  319  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  30.93 
 
 
602 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 
646 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  30.93 
 
 
602 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 
611 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  32.38 
 
 
636 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 
629 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.53 
 
 
647 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 
630 aa  318  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  32.27 
 
 
632 aa  317  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  33.88 
 
 
629 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  32.99 
 
 
609 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  33.55 
 
 
629 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  32.69 
 
 
618 aa  316  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 
602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 
621 aa  314  2.9999999999999996e-84  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  33.72 
 
 
629 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.15 
 
 
641 aa  313  6.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  32.67 
 
 
618 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  32.2 
 
 
618 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  32.1 
 
 
638 aa  313  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 
618 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 
618 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 
618 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 
618 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 
618 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
662 aa  311  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 
618 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
610 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
637 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 
628 aa  310  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 
648 aa  309  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 
648 aa  309  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 
633 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 
640 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 
664 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 
646 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 
618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  33.62 
 
 
588 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 
631 aa  306  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  32.36 
 
 
638 aa  306  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 
648 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 
618 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
610 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  30.19 
 
 
634 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>