More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1073 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  51.42 
 
 		 608 aa  644    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1073  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 604 aa  1241    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0670  penicillin-binding protein 2  49.84 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.265055  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  51.2 
 
 		 599 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0450  penicillin-binding protein 2  50.74 
 
 		 609 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  50.25 
 
 		 601 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  49.92 
 
 		 601 aa  601  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1995  penicillin-binding protein 2  50.33 
 
 		 607 aa  599  1e-170  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  50.76 
 
 		 608 aa  600  1e-170  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1182  penicillin-binding protein 2  48.41 
 
 		 602 aa  594  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  34.78 
 
 		 597 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 640 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 		 645 aa  325  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 		 602 aa  324  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  34.54 
 
 		 611 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  32.72 
 
 		 755 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  32.94 
 
 		 602 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  32.94 
 
 		 602 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.72 
 
 		 639 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  33.5 
 
 		 619 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  31.69 
 
 		 586 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  32.77 
 
 		 662 aa  306  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 		 643 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 		 630 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.27 
 
 		 645 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 		 637 aa  303  6.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.39 
 
 		 647 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  33.67 
 
 		 600 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 628 aa  303  9e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 		 595 aa  302  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 		 681 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  33.51 
 
 		 636 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  33.79 
 
 		 627 aa  300  7e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  32.15 
 
 		 626 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 		 662 aa  296  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 648 aa  296  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 648 aa  296  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 		 678 aa  296  9e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  33.05 
 
 		 631 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  31.85 
 
 		 647 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  32.39 
 
 		 609 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.3 
 
 		 628 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 		 632 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 		 689 aa  293  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 		 648 aa  293  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  32.89 
 
 		 664 aa  293  5e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 		 607 aa  293  6e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 		 646 aa  292  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 		 634 aa  291  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 		 619 aa  291  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  31.38 
 
 		 629 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 		 648 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 		 627 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  30.46 
 
 		 646 aa  290  7e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.11 
 
 		 633 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 		 631 aa  287  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.86 
 
 		 631 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 		 643 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 		 624 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  31.86 
 
 		 646 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  32.05 
 
 		 633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  32.05 
 
 		 633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 		 631 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  32.05 
 
 		 633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  32.05 
 
 		 633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  32.05 
 
 		 633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 		 642 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 634 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.69 
 
 		 629 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  30.13 
 
 		 638 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  31.02 
 
 		 633 aa  283  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.16 
 
 		 641 aa  282  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 641 aa  282  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  30.56 
 
 		 634 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 		 618 aa  281  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  30.34 
 
 		 634 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 		 640 aa  280  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 		 588 aa  280  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  30.48 
 
 		 633 aa  279  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.34 
 
 		 629 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  30.23 
 
 		 634 aa  279  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 		 629 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  32.03 
 
 		 646 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  30.72 
 
 		 632 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 		 618 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  31.93 
 
 		 647 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  30.32 
 
 		 633 aa  278  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 		 633 aa  278  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 		 633 aa  278  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 		 633 aa  278  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 		 633 aa  278  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  30.32 
 
 		 633 aa  278  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  31.36 
 
 		 638 aa  278  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 		 633 aa  278  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 		 633 aa  277  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  31.99 
 
 		 631 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 		 618 aa  277  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  31.99 
 
 		 631 aa  277  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>