More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2482 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 628 aa  1291    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  53.1 
 
 		 681 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  49.42 
 
 		 647 aa  611  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  47.1 
 
 		 648 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  47.1 
 
 		 648 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  46.61 
 
 		 648 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  48.84 
 
 		 624 aa  573  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  48.59 
 
 		 634 aa  568  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  47.66 
 
 		 648 aa  570  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  46.27 
 
 		 647 aa  557  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  46.18 
 
 		 649 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  46.05 
 
 		 658 aa  524  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  46.77 
 
 		 670 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  45.01 
 
 		 662 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  42.67 
 
 		 639 aa  487  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  42.59 
 
 		 689 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  42.71 
 
 		 636 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.35 
 
 		 609 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  40.6 
 
 		 619 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  39.21 
 
 		 634 aa  415  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  37.32 
 
 		 643 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  36.19 
 
 		 639 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  38.47 
 
 		 611 aa  392  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  39.21 
 
 		 646 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  36.54 
 
 		 627 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  38.13 
 
 		 630 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 		 645 aa  392  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  39.05 
 
 		 630 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  37.38 
 
 		 631 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  38.2 
 
 		 630 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  37.56 
 
 		 629 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.45 
 
 		 618 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  37.6 
 
 		 629 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  37.79 
 
 		 629 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  37.54 
 
 		 646 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  36.08 
 
 		 636 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  36.84 
 
 		 640 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  36.33 
 
 		 634 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  37.86 
 
 		 629 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  38.05 
 
 		 631 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  37.93 
 
 		 631 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.05 
 
 		 667 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.22 
 
 		 642 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  35.03 
 
 		 645 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  37.76 
 
 		 631 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  37.86 
 
 		 655 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  37.75 
 
 		 627 aa  375  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  34.85 
 
 		 647 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  36.89 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  35.31 
 
 		 618 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  35.87 
 
 		 634 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  35.58 
 
 		 636 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  36.35 
 
 		 678 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 		 646 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  35.56 
 
 		 631 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  37.03 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  35.15 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  38.28 
 
 		 630 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  36.11 
 
 		 602 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 618 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 618 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 618 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  36.11 
 
 		 602 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 		 610 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 		 643 aa  365  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  36.16 
 
 		 662 aa  363  4e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 		 793 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.32 
 
 		 619 aa  363  6e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 		 766 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 664 aa  362  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  37.63 
 
 		 630 aa  361  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  37.03 
 
 		 629 aa  360  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  36.74 
 
 		 632 aa  360  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 		 618 aa  359  8e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 		 618 aa  359  8e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 		 618 aa  359  8e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  34.6 
 
 		 618 aa  359  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  35.11 
 
 		 633 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  35.11 
 
 		 633 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  35.11 
 
 		 633 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  35.11 
 
 		 633 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  35.11 
 
 		 633 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 		 610 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  34.88 
 
 		 634 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 		 673 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 		 618 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  35.26 
 
 		 640 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  35.48 
 
 		 637 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  33.77 
 
 		 628 aa  357  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  34.88 
 
 		 801 aa  357  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 		 633 aa  356  5.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  36.56 
 
 		 602 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 		 646 aa  356  8.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>