More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2079 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 639 aa  1304    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  65.55 
 
 		 647 aa  866    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  73.95 
 
 		 643 aa  1001    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  65.21 
 
 		 645 aa  857    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  63.04 
 
 		 640 aa  782    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  68.85 
 
 		 636 aa  890    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  66.45 
 
 		 642 aa  853    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  51.07 
 
 		 619 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  42.26 
 
 		 634 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  41.62 
 
 		 646 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  39.34 
 
 		 646 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  37.97 
 
 		 645 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  40.89 
 
 		 609 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  39.76 
 
 		 597 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.66 
 
 		 618 aa  425  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  39.51 
 
 		 611 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 		 636 aa  419  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  38.67 
 
 		 631 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  38.27 
 
 		 629 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  38.54 
 
 		 629 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  39.19 
 
 		 630 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  38.54 
 
 		 629 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  38.54 
 
 		 629 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  37.44 
 
 		 630 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  37.89 
 
 		 630 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  38.33 
 
 		 631 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  38.33 
 
 		 631 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  37.24 
 
 		 574 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  38.86 
 
 		 630 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  36.74 
 
 		 755 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  39.07 
 
 		 600 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  36.74 
 
 		 631 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  35.85 
 
 		 661 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.74 
 
 		 667 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  36.51 
 
 		 630 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  37.65 
 
 		 646 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  38.58 
 
 		 626 aa  399  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  37.5 
 
 		 646 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  36.62 
 
 		 629 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  36.26 
 
 		 629 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  36.9 
 
 		 655 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  38.81 
 
 		 646 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  38.25 
 
 		 648 aa  392  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  35.93 
 
 		 612 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  35.51 
 
 		 617 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  36.32 
 
 		 628 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 		 633 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 		 643 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 		 637 aa  389  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  35.76 
 
 		 615 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.33 
 
 		 640 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  35.16 
 
 		 617 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  37.34 
 
 		 648 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  37.34 
 
 		 648 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  37.18 
 
 		 681 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 		 655 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.89 
 
 		 619 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  37.76 
 
 		 681 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  35.54 
 
 		 637 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  36.45 
 
 		 648 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  34.59 
 
 		 691 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 		 618 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 		 618 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  37.1 
 
 		 624 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 		 610 aa  382  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  34.02 
 
 		 628 aa  382  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  37.02 
 
 		 647 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  36.06 
 
 		 618 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  35.08 
 
 		 801 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  35.23 
 
 		 618 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  35.01 
 
 		 623 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 		 673 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  35.28 
 
 		 618 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 		 618 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  36.51 
 
 		 632 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  38 
 
 		 595 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 		 618 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 602 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  35.32 
 
 		 623 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  35.32 
 
 		 623 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.06 
 
 		 641 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  36.85 
 
 		 640 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  35.32 
 
 		 623 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  35.01 
 
 		 623 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  35.46 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  38.54 
 
 		 808 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  37.69 
 
 		 662 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  35.29 
 
 		 633 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  35.47 
 
 		 631 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  35.29 
 
 		 633 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  35.57 
 
 		 599 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  34.39 
 
 		 800 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  35.3 
 
 		 631 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 640 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  35.29 
 
 		 633 aa  369  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  35.73 
 
 		 803 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  35.29 
 
 		 633 aa  369  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  37.06 
 
 		 689 aa  369  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  35.29 
 
 		 633 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  35.78 
 
 		 802 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>