More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1336 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  58.43 
 
 		 633 aa  738    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  58.43 
 
 		 633 aa  738    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  58.36 
 
 		 633 aa  731    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  73.23 
 
 		 641 aa  965    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  56.91 
 
 		 634 aa  715    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  59.02 
 
 		 633 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  58.39 
 
 		 631 aa  736    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  59.02 
 
 		 633 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  58.13 
 
 		 631 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  58.43 
 
 		 633 aa  738    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  59.26 
 
 		 634 aa  750    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  99.52 
 
 		 623 aa  1286    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  58.43 
 
 		 633 aa  739    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  58.43 
 
 		 633 aa  738    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 623 aa  1292    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  58.43 
 
 		 633 aa  738    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  99.52 
 
 		 623 aa  1286    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  51.72 
 
 		 637 aa  650    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  58.43 
 
 		 633 aa  738    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  58.43 
 
 		 633 aa  738    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  99.36 
 
 		 623 aa  1282    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  99.36 
 
 		 623 aa  1285    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  57.05 
 
 		 636 aa  712    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  58.43 
 
 		 633 aa  738    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  58.55 
 
 		 631 aa  738    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  58.39 
 
 		 631 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  59.02 
 
 		 633 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  59.02 
 
 		 633 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  57.73 
 
 		 634 aa  724    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  59.02 
 
 		 633 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  51.89 
 
 		 621 aa  626  1e-178  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  47.97 
 
 		 638 aa  608  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  48.26 
 
 		 638 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  48.38 
 
 		 632 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  46.93 
 
 		 641 aa  601  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  48.52 
 
 		 625 aa  593  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  45.57 
 
 		 618 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  45.57 
 
 		 618 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  45.57 
 
 		 618 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  45.57 
 
 		 618 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  45.41 
 
 		 618 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  46.38 
 
 		 610 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  44.46 
 
 		 643 aa  561  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  44.75 
 
 		 618 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  44.75 
 
 		 618 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  45.25 
 
 		 618 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  44.92 
 
 		 618 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  45.89 
 
 		 627 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  45.08 
 
 		 618 aa  552  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  44.74 
 
 		 628 aa  554  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  44.26 
 
 		 618 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  42.52 
 
 		 652 aa  544  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  43.59 
 
 		 637 aa  544  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  43.38 
 
 		 610 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  44.68 
 
 		 618 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  44.26 
 
 		 618 aa  525  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  40.42 
 
 		 630 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  39.9 
 
 		 645 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  41.8 
 
 		 646 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  39.9 
 
 		 631 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  39.93 
 
 		 629 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  40.98 
 
 		 646 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  38.55 
 
 		 633 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  41.42 
 
 		 678 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  39.51 
 
 		 629 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  39.8 
 
 		 629 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  40.33 
 
 		 612 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  40.95 
 
 		 631 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  41.12 
 
 		 631 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  39.35 
 
 		 629 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  40.33 
 
 		 615 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.31 
 
 		 618 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  40.36 
 
 		 627 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  39.71 
 
 		 626 aa  462  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  41.16 
 
 		 664 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  40.66 
 
 		 662 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  40.07 
 
 		 630 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  39.67 
 
 		 686 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  40.1 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 		 640 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  41.04 
 
 		 617 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  41.39 
 
 		 617 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  38.76 
 
 		 636 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  38.52 
 
 		 646 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  39.15 
 
 		 630 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  40.1 
 
 		 687 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  39.51 
 
 		 631 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  39.7 
 
 		 630 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  40.1 
 
 		 687 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  38.67 
 
 		 703 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  39.19 
 
 		 655 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  39.51 
 
 		 667 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  39.12 
 
 		 607 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  38.79 
 
 		 809 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  39.63 
 
 		 626 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  39.48 
 
 		 619 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  38.28 
 
 		 632 aa  445  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  37.76 
 
 		 766 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  38.79 
 
 		 803 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  38.54 
 
 		 673 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>