More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0580 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  53.08 
 
 
600 aa  657    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  51.61 
 
 
610 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
605 aa  1236    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  54.91 
 
 
612 aa  663    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  54.91 
 
 
612 aa  663    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  55.16 
 
 
613 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  55.98 
 
 
596 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00491  putative penicillin-binding protein  45.39 
 
 
600 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  45.01 
 
 
615 aa  458  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0050  peptidoglycan glycosyltransferase  45.41 
 
 
595 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00431  putative penicillin-binding protein  41.15 
 
 
602 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.689764  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  39.42 
 
 
609 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  39.79 
 
 
597 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  39.26 
 
 
609 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0041  putative penicillin-binding protein  39.67 
 
 
596 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.381944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  38.8 
 
 
603 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00411  putative penicillin-binding protein  39.05 
 
 
548 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.563194  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  37.04 
 
 
548 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00431  putative penicillin-binding protein  38 
 
 
548 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.876633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  36.06 
 
 
645 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  36.57 
 
 
639 aa  353  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  35.87 
 
 
647 aa  350  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  35.87 
 
 
646 aa  341  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 
643 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  37.43 
 
 
640 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  38.24 
 
 
586 aa  334  3e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.7 
 
 
636 aa  334  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.75 
 
 
642 aa  334  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  36.27 
 
 
636 aa  329  9e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 
645 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 
658 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  35.58 
 
 
646 aa  321  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  34 
 
 
574 aa  320  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
664 aa  318  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  35.25 
 
 
609 aa  319  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
662 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.13 
 
 
671 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  35.62 
 
 
634 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  36.49 
 
 
619 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  33.99 
 
 
599 aa  313  5.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  34.97 
 
 
681 aa  310  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  33.5 
 
 
617 aa  310  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  33.94 
 
 
678 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 
683 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 
617 aa  308  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  32.77 
 
 
661 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 
641 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 
630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
673 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  35.38 
 
 
602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  35.38 
 
 
602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  33.71 
 
 
631 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 
691 aa  301  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
646 aa  301  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  33.55 
 
 
623 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  33.77 
 
 
648 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  32.7 
 
 
655 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 
648 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  33.94 
 
 
761 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
623 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 
648 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  34.79 
 
 
632 aa  299  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
623 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 
764 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  32.61 
 
 
629 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 
655 aa  298  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  32.68 
 
 
652 aa  298  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 
623 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  33.77 
 
 
809 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 
629 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 
623 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  33.77 
 
 
803 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  33.94 
 
 
802 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  33.61 
 
 
803 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  32.61 
 
 
629 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 
775 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  33.77 
 
 
765 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.77 
 
 
765 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  33.77 
 
 
760 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  34.75 
 
 
647 aa  296  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  32.62 
 
 
679 aa  295  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 
802 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 
802 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 
802 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  33.95 
 
 
627 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 
802 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  32.82 
 
 
646 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  33.33 
 
 
631 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.07 
 
 
629 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 
793 aa  294  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  33.94 
 
 
756 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 
648 aa  294  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
588 aa  293  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
631 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  34.25 
 
 
646 aa  292  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 
767 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.99 
 
 
643 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 
626 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  32.43 
 
 
628 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  34.02 
 
 
631 aa  291  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>