More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1085 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 625 aa  1264    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  48.79 
 
 		 588 aa  545  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.83 
 
 		 586 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  33.6 
 
 		 678 aa  313  6.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 		 662 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 		 636 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  31.79 
 
 		 664 aa  300  8e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 		 643 aa  299  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 		 646 aa  297  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  29.44 
 
 		 639 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  31.99 
 
 		 681 aa  293  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  30.88 
 
 		 646 aa  288  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 		 645 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 		 640 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.28 
 
 		 643 aa  286  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.57 
 
 		 640 aa  286  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 		 574 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  31.02 
 
 		 641 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  32.18 
 
 		 610 aa  283  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  31.52 
 
 		 809 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  31.83 
 
 		 802 aa  281  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 		 803 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  31.52 
 
 		 803 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 		 633 aa  280  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  32.64 
 
 		 599 aa  281  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 		 636 aa  280  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 		 802 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 		 597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 		 802 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 		 767 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 		 802 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 		 802 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  29.31 
 
 		 755 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.48 
 
 		 645 aa  275  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  29.78 
 
 		 801 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.6 
 
 		 771 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 		 634 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 		 634 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.18 
 
 		 642 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  30.59 
 
 		 801 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  30.92 
 
 		 631 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  30.27 
 
 		 801 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 		 626 aa  270  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 595 aa  270  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 		 607 aa  269  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  28.89 
 
 		 647 aa  269  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 		 637 aa  268  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 766 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 681 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  31.83 
 
 		 631 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  29.44 
 
 		 596 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  31.83 
 
 		 631 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 673 aa  266  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  31.83 
 
 		 631 aa  266  8e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 		 619 aa  266  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 793 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  29.58 
 
 		 661 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  30.36 
 
 		 647 aa  264  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 		 764 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  29.76 
 
 		 646 aa  263  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  29.52 
 
 		 800 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 		 761 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  31.27 
 
 		 599 aa  263  8.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  31.74 
 
 		 601 aa  262  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  29.3 
 
 		 626 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 		 605 aa  262  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  30.63 
 
 		 600 aa  262  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  31.78 
 
 		 775 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  27.61 
 
 		 628 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 		 635 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 		 610 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 		 618 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  31.25 
 
 		 756 aa  261  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 		 765 aa  261  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 		 765 aa  261  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  29.8 
 
 		 600 aa  260  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  31.4 
 
 		 760 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  30.77 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  30.77 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.44 
 
 		 671 aa  259  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 		 634 aa  260  7e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  31.06 
 
 		 636 aa  259  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  31.11 
 
 		 601 aa  259  8e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  30.24 
 
 		 602 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 		 557 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  27.33 
 
 		 632 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  30.3 
 
 		 687 aa  258  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  30.83 
 
 		 681 aa  258  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 		 687 aa  258  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  30.13 
 
 		 640 aa  257  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  31.4 
 
 		 634 aa  257  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  29.51 
 
 		 646 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 		 658 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>