More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0327 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  93.36 
 
 
557 aa  1077    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
557 aa  1135    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  38.66 
 
 
533 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  38.72 
 
 
547 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1422  peptidoglycan glycosyltransferase  39.25 
 
 
569 aa  372  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.38449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  36.74 
 
 
574 aa  343  5.999999999999999e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 
646 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.27 
 
 
645 aa  290  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 
627 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  35.62 
 
 
701 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  31.6 
 
 
646 aa  286  7e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  32.19 
 
 
611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 
609 aa  284  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 
633 aa  283  6.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.87 
 
 
586 aa  282  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  32.26 
 
 
630 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 
671 aa  279  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  29.67 
 
 
643 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.4 
 
 
640 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.57 
 
 
636 aa  277  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  34.5 
 
 
619 aa  276  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.15 
 
 
639 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.29 
 
 
647 aa  273  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 
607 aa  272  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 
662 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.26 
 
 
632 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.71 
 
 
645 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  31.01 
 
 
621 aa  268  2e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
626 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  37.75 
 
 
709 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  31.17 
 
 
681 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.26 
 
 
628 aa  266  8e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.06 
 
 
628 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  31.74 
 
 
599 aa  265  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  29.39 
 
 
643 aa  264  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  29.9 
 
 
678 aa  263  8e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.97 
 
 
618 aa  263  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 
664 aa  262  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 
636 aa  262  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 
630 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 
643 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  29.06 
 
 
619 aa  259  7e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  31.4 
 
 
588 aa  259  8e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  30.25 
 
 
625 aa  258  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  30.29 
 
 
631 aa  257  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  30.05 
 
 
634 aa  257  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  31.01 
 
 
634 aa  256  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  28.93 
 
 
629 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.11 
 
 
629 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  29.77 
 
 
646 aa  256  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.11 
 
 
629 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.85 
 
 
642 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  30.74 
 
 
630 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  29.54 
 
 
629 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  29.28 
 
 
633 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  29.28 
 
 
633 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  29.28 
 
 
633 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  29.28 
 
 
633 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  29.28 
 
 
633 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  29.11 
 
 
634 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  29.95 
 
 
634 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  30.46 
 
 
641 aa  252  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  29.41 
 
 
640 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  29.18 
 
 
637 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.99 
 
 
658 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  29.03 
 
 
633 aa  250  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  30.6 
 
 
610 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  28.78 
 
 
633 aa  250  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  30.33 
 
 
615 aa  250  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  29.75 
 
 
631 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  28.78 
 
 
633 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  28.78 
 
 
633 aa  249  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  30.33 
 
 
612 aa  249  8e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  30.37 
 
 
586 aa  249  8e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  28.78 
 
 
633 aa  249  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  28.78 
 
 
633 aa  249  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  28.78 
 
 
633 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  28.78 
 
 
633 aa  249  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  28.78 
 
 
633 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 
634 aa  249  9e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.93 
 
 
646 aa  249  9e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  29.9 
 
 
631 aa  249  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  29.58 
 
 
631 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  29.74 
 
 
631 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 
626 aa  249  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  30.55 
 
 
617 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  30.89 
 
 
617 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  28.62 
 
 
635 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  29.47 
 
 
602 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  29.74 
 
 
631 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  30.31 
 
 
610 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  29.47 
 
 
602 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 
618 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.15 
 
 
646 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  29.98 
 
 
646 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  28.62 
 
 
633 aa  247  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 
647 aa  247  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  29.44 
 
 
618 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 
631 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  29.05 
 
 
618 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>