More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1404 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  58.2 
 
 		 622 aa  746    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 619 aa  1281    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  55.74 
 
 		 657 aa  694    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  44.55 
 
 		 664 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  44.37 
 
 		 600 aa  495  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  42.41 
 
 		 596 aa  484  1e-135  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.83 
 
 		 651 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  41.74 
 
 		 648 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3202  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.89 
 
 		 654 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000159747  normal  0.0376991 
 
 
-
 
NC_002950  PG1393  penicillin-binding protein 2, putative  42.09 
 
 		 621 aa  439  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0265808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  38.33 
 
 		 640 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  40.14 
 
 		 615 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  37.25 
 
 		 610 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  34.16 
 
 		 639 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 		 643 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  35.46 
 
 		 646 aa  323  6e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  36.53 
 
 		 641 aa  318  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  35.25 
 
 		 647 aa  317  3e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  32.94 
 
 		 645 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.72 
 
 		 647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  35.18 
 
 		 643 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 		 642 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 634 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 		 646 aa  296  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 		 636 aa  294  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.49 
 
 		 633 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  33.49 
 
 		 650 aa  283  9e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 662 aa  283  9e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 		 673 aa  281  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  33.33 
 
 		 619 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  31.88 
 
 		 640 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 		 664 aa  276  7e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  33.79 
 
 		 611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 		 648 aa  274  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 		 636 aa  273  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 		 678 aa  272  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 		 634 aa  270  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  33.12 
 
 		 627 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 		 630 aa  263  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  32.14 
 
 		 679 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 618 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  32.64 
 
 		 801 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 645 aa  262  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 		 703 aa  261  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 		 630 aa  260  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 		 610 aa  260  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 643 aa  258  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  32.11 
 
 		 630 aa  258  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 646 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 		 632 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  32.33 
 
 		 631 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 		 609 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 		 618 aa  253  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  31.44 
 
 		 618 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  32.4 
 
 		 627 aa  252  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  30.21 
 
 		 638 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  32.55 
 
 		 646 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 		 646 aa  252  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  32.48 
 
 		 803 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 		 631 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  32.49 
 
 		 646 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  32.48 
 
 		 803 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  34.4 
 
 		 681 aa  251  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 		 655 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  32.48 
 
 		 809 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 		 691 aa  250  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  32.38 
 
 		 802 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  32.38 
 
 		 802 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  32.38 
 
 		 802 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  32.38 
 
 		 802 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  32.48 
 
 		 802 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  31.27 
 
 		 637 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.48 
 
 		 641 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  31.72 
 
 		 618 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 618 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 618 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 618 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 		 631 aa  247  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 		 667 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  29.17 
 
 		 631 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 618 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 618 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 618 aa  246  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.68 
 
 		 629 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  32.48 
 
 		 775 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  31.81 
 
 		 646 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  29.17 
 
 		 630 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  32.37 
 
 		 801 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.52 
 
 		 629 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  29.18 
 
 		 655 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  30.3 
 
 		 663 aa  244  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  32.15 
 
 		 801 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 		 618 aa  243  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.52 
 
 		 629 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  28.95 
 
 		 629 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 		 766 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  31.41 
 
 		 618 aa  242  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 		 630 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  31.66 
 
 		 681 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 		 683 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>