More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0769 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 644 aa  1299    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 655 aa  321  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  35.02 
 
 		 670 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 671 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  34.45 
 
 		 646 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  31.32 
 
 		 686 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 729 aa  313  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 		 764 aa  312  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  32.62 
 
 		 661 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 708 aa  307  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  31.92 
 
 		 697 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  33.74 
 
 		 667 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 		 658 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.46 
 
 		 692 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  30.92 
 
 		 716 aa  290  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 		 625 aa  290  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 		 636 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 		 643 aa  286  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  31.62 
 
 		 716 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 646 aa  284  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.57 
 
 		 645 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  33.38 
 
 		 724 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.94 
 
 		 645 aa  280  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30 
 
 		 647 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  30.65 
 
 		 612 aa  278  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  30.65 
 
 		 615 aa  276  9e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 		 641 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 		 639 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  32.61 
 
 		 701 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  31.22 
 
 		 703 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0751  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 		 772 aa  269  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.810278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  30.57 
 
 		 627 aa  267  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.2 
 
 		 630 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 		 632 aa  267  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 650 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 		 626 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 687 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  30.05 
 
 		 618 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  31.16 
 
 		 630 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 		 610 aa  261  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  29.55 
 
 		 630 aa  261  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  29.37 
 
 		 623 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  29.54 
 
 		 802 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  29.37 
 
 		 623 aa  260  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  29.69 
 
 		 803 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  29.69 
 
 		 809 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  29.52 
 
 		 623 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  29.69 
 
 		 802 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  29.69 
 
 		 802 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  29.69 
 
 		 802 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  29.48 
 
 		 623 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  29.69 
 
 		 802 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  29.37 
 
 		 623 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  30.19 
 
 		 679 aa  257  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  30 
 
 		 800 aa  257  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  29.09 
 
 		 610 aa  256  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 		 609 aa  256  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  29.54 
 
 		 803 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 		 642 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 637 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  30.83 
 
 		 724 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  29.67 
 
 		 632 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  27.96 
 
 		 703 aa  254  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 		 618 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 		 678 aa  254  5.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 		 669 aa  253  9.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  28.89 
 
 		 629 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  28.44 
 
 		 637 aa  252  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 667 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  29.38 
 
 		 756 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 		 765 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  29.08 
 
 		 760 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 		 765 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.5 
 
 		 646 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  29.32 
 
 		 618 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  29.32 
 
 		 618 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  29.32 
 
 		 618 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  29.32 
 
 		 618 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  28.82 
 
 		 629 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 		 761 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  29.23 
 
 		 764 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  30.06 
 
 		 631 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  29.91 
 
 		 681 aa  250  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 		 655 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 		 629 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  29.8 
 
 		 596 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  28.73 
 
 		 643 aa  249  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  28.62 
 
 		 775 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  31.41 
 
 		 640 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 		 629 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 631 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  29.15 
 
 		 633 aa  249  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  29.44 
 
 		 629 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.61 
 
 		 636 aa  248  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  30.48 
 
 		 655 aa  248  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  28.73 
 
 		 629 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  28.8 
 
 		 617 aa  247  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  28.68 
 
 		 634 aa  246  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  28.59 
 
 		 618 aa  247  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.08 
 
 		 643 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>