More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3462 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 708 aa  1446    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  46.29 
 
 		 697 aa  599  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  43.53 
 
 		 686 aa  547  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  43.36 
 
 		 724 aa  539  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  40.93 
 
 		 716 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  44.3 
 
 		 670 aa  519  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.91 
 
 		 692 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0751  peptidoglycan glycosyltransferase  40 
 
 		 772 aa  465  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.810278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  40.17 
 
 		 764 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  40 
 
 		 729 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09230  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.98 
 
 		 760 aa  405  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.922372 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 		 644 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  30.35 
 
 		 661 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 		 687 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  30.99 
 
 		 646 aa  278  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  30.98 
 
 		 667 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 		 658 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  29.76 
 
 		 655 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  27.98 
 
 		 703 aa  243  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  28.96 
 
 		 669 aa  234  5e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  28.51 
 
 		 716 aa  232  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  26.5 
 
 		 647 aa  230  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 		 600 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  26.01 
 
 		 645 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  28.55 
 
 		 636 aa  226  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  27.96 
 
 		 640 aa  226  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  27.62 
 
 		 640 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  30.34 
 
 		 724 aa  225  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.5 
 
 		 671 aa  226  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  27.46 
 
 		 639 aa  224  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  28.96 
 
 		 697 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  28.05 
 
 		 669 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  29.54 
 
 		 619 aa  220  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  26.4 
 
 		 679 aa  219  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  27.76 
 
 		 617 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  27.88 
 
 		 691 aa  218  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  28.26 
 
 		 808 aa  217  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  26.44 
 
 		 755 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  26.72 
 
 		 619 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  27.38 
 
 		 610 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  26.22 
 
 		 703 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.37 
 
 		 643 aa  213  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  26.18 
 
 		 645 aa  213  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  26.32 
 
 		 574 aa  213  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  27.67 
 
 		 684 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  27.99 
 
 		 684 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  26.97 
 
 		 801 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  26.97 
 
 		 801 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 		 709 aa  211  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  27.99 
 
 		 682 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  29.1 
 
 		 596 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  27.33 
 
 		 595 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  27.83 
 
 		 681 aa  208  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  25.48 
 
 		 636 aa  207  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  27.19 
 
 		 650 aa  207  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  28.28 
 
 		 610 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  26.63 
 
 		 691 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  26.35 
 
 		 586 aa  206  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  28.11 
 
 		 631 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  26.65 
 
 		 633 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  26.18 
 
 		 673 aa  206  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.6 
 
 		 761 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  27.88 
 
 		 629 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  28.71 
 
 		 617 aa  204  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  28.11 
 
 		 586 aa  204  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  28.19 
 
 		 597 aa  204  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  27.22 
 
 		 602 aa  204  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  26.63 
 
 		 646 aa  203  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.46 
 
 		 618 aa  203  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  27.86 
 
 		 629 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  27.42 
 
 		 629 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  25.11 
 
 		 801 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  28.71 
 
 		 617 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  27.02 
 
 		 630 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00491  putative penicillin-binding protein  29.26 
 
 		 600 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14210  penicillin-binding protein 2  27.5 
 
 		 709 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  26.5 
 
 		 626 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  27.71 
 
 		 629 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  26.84 
 
 		 643 aa  201  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  28.16 
 
 		 630 aa  201  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  25.73 
 
 		 646 aa  200  6e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  26.01 
 
 		 663 aa  200  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  27.6 
 
 		 640 aa  200  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  26.32 
 
 		 631 aa  200  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  27.51 
 
 		 600 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  25.5 
 
 		 766 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  25.97 
 
 		 771 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  26.37 
 
 		 588 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  27.02 
 
 		 683 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1624  penicillin-binding protein 2  30.83 
 
 		 738 aa  198  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  27.18 
 
 		 632 aa  198  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  27.32 
 
 		 625 aa  197  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  26.09 
 
 		 632 aa  197  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  25.87 
 
 		 633 aa  197  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  25.87 
 
 		 633 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  25.87 
 
 		 633 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  25.87 
 
 		 633 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  25.87 
 
 		 633 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  26.74 
 
 		 689 aa  196  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  25.97 
 
 		 767 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>