More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09230 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_09230  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  100 
 
 
760 aa  1544    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.922372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  41.72 
 
 
697 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  38.44 
 
 
716 aa  469  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  40.41 
 
 
670 aa  445  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  36.65 
 
 
686 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  37.33 
 
 
764 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  36.76 
 
 
708 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 
729 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.17 
 
 
692 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  33.64 
 
 
724 aa  353  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0751  peptidoglycan glycosyltransferase  33.38 
 
 
772 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.810278  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 
655 aa  243  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.43 
 
 
658 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  27.67 
 
 
661 aa  229  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 
646 aa  227  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  28.32 
 
 
636 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  29.44 
 
 
687 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  29.26 
 
 
619 aa  224  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  26.57 
 
 
645 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  26.35 
 
 
647 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  27.87 
 
 
716 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  27.04 
 
 
574 aa  213  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  25.88 
 
 
636 aa  212  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.08 
 
 
671 aa  211  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14210  penicillin-binding protein 2  28.76 
 
 
709 aa  209  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 
600 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  26.69 
 
 
639 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  26.55 
 
 
628 aa  207  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  25.41 
 
 
640 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  26.05 
 
 
640 aa  204  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  26.1 
 
 
588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  26.04 
 
 
642 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  24.6 
 
 
586 aa  200  7e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4064  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 
765 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  28.14 
 
 
681 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  26.41 
 
 
647 aa  197  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  26.53 
 
 
610 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  26.25 
 
 
667 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  26.57 
 
 
633 aa  194  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  27.86 
 
 
724 aa  193  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  25.73 
 
 
634 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  25.7 
 
 
643 aa  193  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  26.73 
 
 
586 aa  193  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  26.14 
 
 
689 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  26.99 
 
 
669 aa  192  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  26.58 
 
 
617 aa  191  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  25.87 
 
 
646 aa  191  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.35 
 
 
761 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  26.12 
 
 
636 aa  190  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  26.38 
 
 
641 aa  190  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  25.99 
 
 
644 aa  189  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  25.93 
 
 
598 aa  189  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  25.74 
 
 
608 aa  188  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  24.26 
 
 
643 aa  187  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  25.99 
 
 
662 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1182  penicillin-binding protein 2  24.64 
 
 
602 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  27.53 
 
 
640 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  26.91 
 
 
681 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  27.05 
 
 
646 aa  185  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  24.07 
 
 
646 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  29.56 
 
 
775 aa  184  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  26.93 
 
 
619 aa  184  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  26.72 
 
 
624 aa  184  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  25.48 
 
 
663 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1995  penicillin-binding protein 2  25.07 
 
 
607 aa  183  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  26.09 
 
 
632 aa  183  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  25.1 
 
 
703 aa  182  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  26.7 
 
 
627 aa  182  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  25.53 
 
 
640 aa  181  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  24.13 
 
 
601 aa  180  7e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  26.22 
 
 
612 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  26.22 
 
 
612 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  26.88 
 
 
605 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  23.52 
 
 
635 aa  179  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  23.65 
 
 
673 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  25.14 
 
 
647 aa  179  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  25.28 
 
 
771 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  26.43 
 
 
626 aa  178  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  26.33 
 
 
808 aa  178  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0742  penicillin-binding protein  24.96 
 
 
599 aa  178  4e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  26.24 
 
 
630 aa  178  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  26.49 
 
 
634 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  25.16 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  24.55 
 
 
647 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0450  penicillin-binding protein 2  24.09 
 
 
609 aa  176  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  26.17 
 
 
615 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  25.64 
 
 
630 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  25.51 
 
 
602 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  23.78 
 
 
755 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  25.51 
 
 
602 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  24.39 
 
 
599 aa  175  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  27.59 
 
 
701 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  25 
 
 
679 aa  175  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  23.67 
 
 
635 aa  175  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  24.78 
 
 
608 aa  175  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  24.13 
 
 
678 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  25.14 
 
 
767 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  23.93 
 
 
669 aa  174  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  24.66 
 
 
625 aa  174  5.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  24.54 
 
 
648 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>