More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1378 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
598 aa  1236    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  35.27 
 
 
574 aa  342  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 
634 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.66 
 
 
645 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  34.29 
 
 
586 aa  287  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 
636 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31 
 
 
639 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 
646 aa  280  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 
643 aa  280  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.56 
 
 
610 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.65 
 
 
647 aa  275  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 
609 aa  272  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  31.97 
 
 
640 aa  272  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  32.53 
 
 
611 aa  270  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  33.11 
 
 
612 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  33.11 
 
 
612 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 
658 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 
678 aa  267  5e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 
671 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  29.74 
 
 
588 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  30.3 
 
 
597 aa  263  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 
643 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  30.18 
 
 
619 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 
655 aa  261  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  30.52 
 
 
669 aa  261  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  31.61 
 
 
646 aa  260  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 
636 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 
645 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 
632 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  30.1 
 
 
640 aa  257  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 
642 aa  257  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  31.15 
 
 
613 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 
605 aa  256  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 
610 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  33.11 
 
 
641 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 
662 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  30.21 
 
 
596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 
627 aa  254  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 
664 aa  253  7e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  30.89 
 
 
617 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  31.22 
 
 
673 aa  252  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  29.73 
 
 
640 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 
618 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  30.38 
 
 
617 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  28.42 
 
 
661 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  30.61 
 
 
619 aa  251  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 
630 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  31.06 
 
 
650 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  30.07 
 
 
600 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 
626 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.08 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  29.68 
 
 
629 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 
586 aa  244  3.9999999999999997e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.08 
 
 
629 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  29.27 
 
 
667 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 
629 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  29.27 
 
 
631 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  29.09 
 
 
610 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 
631 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  29.32 
 
 
655 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.21 
 
 
628 aa  241  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  30.56 
 
 
600 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 
683 aa  239  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 
627 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 
602 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  31.34 
 
 
691 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.06 
 
 
767 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  28.08 
 
 
716 aa  239  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 
618 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.73 
 
 
771 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  30.17 
 
 
647 aa  238  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 
646 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  31.07 
 
 
655 aa  237  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  29.63 
 
 
802 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 
634 aa  236  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  30.35 
 
 
681 aa  236  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  28.96 
 
 
623 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  27.36 
 
 
646 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 
646 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  29.23 
 
 
618 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  29.02 
 
 
618 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 
618 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 
618 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.05 
 
 
646 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  31.28 
 
 
646 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  30.76 
 
 
631 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  28.11 
 
 
630 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  28.8 
 
 
623 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 
618 aa  234  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.24 
 
 
633 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
631 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  29.46 
 
 
612 aa  233  9e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  27.38 
 
 
691 aa  233  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  29.46 
 
 
615 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 
623 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 
623 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  29.59 
 
 
557 aa  232  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 
623 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  29.37 
 
 
802 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  29.37 
 
 
802 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>