More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2465 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  55.05 
 
 
670 aa  676    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
686 aa  1386    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  65.54 
 
 
692 aa  871    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  57.66 
 
 
697 aa  775    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  51.08 
 
 
716 aa  706    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  47.31 
 
 
764 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  46.81 
 
 
729 aa  558  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  43.53 
 
 
708 aa  547  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  44.23 
 
 
724 aa  527  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0751  peptidoglycan glycosyltransferase  40.11 
 
 
772 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.810278  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09230  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.77 
 
 
760 aa  412  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.922372 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  31.32 
 
 
644 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  30.87 
 
 
661 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  33.38 
 
 
667 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  33.04 
 
 
646 aa  295  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 
687 aa  289  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  31.42 
 
 
724 aa  287  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
655 aa  276  7e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 
658 aa  271  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  31.3 
 
 
669 aa  266  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  30.59 
 
 
697 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 
716 aa  260  6e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.23 
 
 
671 aa  258  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14210  penicillin-binding protein 2  30.12 
 
 
709 aa  253  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  28.49 
 
 
703 aa  251  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  27.31 
 
 
636 aa  248  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 
643 aa  247  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 
691 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.77 
 
 
628 aa  242  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  28.44 
 
 
639 aa  240  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  27.44 
 
 
640 aa  241  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  29.77 
 
 
689 aa  239  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  28 
 
 
645 aa  239  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  28.04 
 
 
602 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 
646 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  27.7 
 
 
636 aa  238  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  29.04 
 
 
681 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.09 
 
 
645 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  27.9 
 
 
635 aa  235  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 
625 aa  234  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  30.58 
 
 
619 aa  234  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  28.83 
 
 
678 aa  233  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 
709 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  27.16 
 
 
703 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  26.5 
 
 
574 aa  233  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.01 
 
 
642 aa  233  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.06 
 
 
633 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  26.87 
 
 
771 aa  233  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  27.47 
 
 
647 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  27.06 
 
 
673 aa  232  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  27.95 
 
 
635 aa  231  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  28.89 
 
 
662 aa  231  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  26.29 
 
 
767 aa  231  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  26.65 
 
 
809 aa  230  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  26.65 
 
 
803 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  26.65 
 
 
802 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  26.65 
 
 
802 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  26.65 
 
 
802 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 
682 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  26.65 
 
 
802 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  26.65 
 
 
802 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  26.67 
 
 
607 aa  228  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  26.7 
 
 
755 aa  228  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  27.27 
 
 
610 aa  228  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.01 
 
 
631 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  26.78 
 
 
646 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  29.33 
 
 
684 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  29.7 
 
 
600 aa  227  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  29.19 
 
 
684 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  26.5 
 
 
803 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  26.54 
 
 
800 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 
808 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  26.7 
 
 
775 aa  226  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  28.79 
 
 
646 aa  226  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  27.97 
 
 
664 aa  225  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  29.27 
 
 
648 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  29.27 
 
 
648 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  27.73 
 
 
629 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  27.87 
 
 
629 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  28.36 
 
 
629 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  28.36 
 
 
629 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  27.41 
 
 
679 aa  223  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  26.8 
 
 
640 aa  223  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  28.46 
 
 
648 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  28.79 
 
 
611 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  25.87 
 
 
801 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  28.66 
 
 
648 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  28.25 
 
 
636 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 
630 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 
609 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  28.3 
 
 
619 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  27.98 
 
 
640 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1624  penicillin-binding protein 2  27.81 
 
 
738 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  25.69 
 
 
766 aa  220  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.93 
 
 
761 aa  220  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  26.64 
 
 
761 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  29.4 
 
 
647 aa  219  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  29.61 
 
 
662 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  26.17 
 
 
623 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  26.17 
 
 
623 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>