More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1260 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  48.7 
 
 		 716 aa  672    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 724 aa  1471    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14210  penicillin-binding protein 2  50.61 
 
 		 709 aa  631  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  38.75 
 
 		 669 aa  407  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  34.5 
 
 		 670 aa  317  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.86 
 
 		 639 aa  302  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 		 643 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  33.07 
 
 		 716 aa  296  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.92 
 
 		 645 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 		 678 aa  293  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  33.23 
 
 		 697 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  32.75 
 
 		 662 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 729 aa  291  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 		 646 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  32.07 
 
 		 664 aa  290  6e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.21 
 
 		 647 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  31.72 
 
 		 686 aa  287  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 		 642 aa  286  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  29.93 
 
 		 574 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  31.42 
 
 		 667 aa  284  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 		 687 aa  280  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 		 764 aa  276  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  30.55 
 
 		 681 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  28.83 
 
 		 645 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  34.05 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 636 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  30.67 
 
 		 618 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 		 609 aa  261  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 		 626 aa  260  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.94 
 
 		 634 aa  260  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  32.29 
 
 		 624 aa  259  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  31.77 
 
 		 619 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  29.97 
 
 		 597 aa  258  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 		 618 aa  258  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 803 aa  257  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  29.98 
 
 		 775 aa  257  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 		 703 aa  257  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 618 aa  257  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  30.41 
 
 		 809 aa  257  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  29.54 
 
 		 767 aa  256  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  30.41 
 
 		 803 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.16 
 
 		 632 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  30.78 
 
 		 644 aa  255  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  29.41 
 
 		 661 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  30.31 
 
 		 802 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 		 673 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  28.92 
 
 		 771 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 		 692 aa  253  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 802 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 802 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 802 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 802 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 		 641 aa  251  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  28.67 
 
 		 640 aa  250  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  28.46 
 
 		 800 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 646 aa  249  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  30.68 
 
 		 631 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  30.25 
 
 		 679 aa  247  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 		 630 aa  246  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  28.68 
 
 		 634 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  29.15 
 
 		 610 aa  243  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  28.44 
 
 		 634 aa  243  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  27.56 
 
 		 628 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  28.34 
 
 		 618 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 		 618 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 		 618 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 		 618 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  30.2 
 
 		 689 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 		 766 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  30.18 
 
 		 633 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.94 
 
 		 641 aa  241  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  30.66 
 
 		 626 aa  240  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  29.55 
 
 		 647 aa  240  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  30.74 
 
 		 611 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  29.61 
 
 		 655 aa  240  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.13 
 
 		 633 aa  240  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  29.98 
 
 		 617 aa  240  8e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  28.68 
 
 		 637 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  28.55 
 
 		 633 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  28.55 
 
 		 633 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  28.8 
 
 		 618 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  28.55 
 
 		 633 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  30.09 
 
 		 801 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  28.55 
 
 		 633 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  29.65 
 
 		 617 aa  239  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  28.55 
 
 		 633 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  28.55 
 
 		 633 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  28.24 
 
 		 793 aa  239  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 		 602 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  28.55 
 
 		 633 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  28.37 
 
 		 618 aa  239  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 		 602 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  31.25 
 
 		 724 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  28.55 
 
 		 633 aa  239  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  28.66 
 
 		 610 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  29.01 
 
 		 638 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  28.55 
 
 		 633 aa  238  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  29.6 
 
 		 619 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  29.08 
 
 		 775 aa  238  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>