More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1138 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 687 aa  1399    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  33.09 
 
 		 667 aa  339  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  34.6 
 
 		 669 aa  311  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  34 
 
 		 697 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  33.08 
 
 		 716 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 		 643 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  32.81 
 
 		 686 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 		 636 aa  298  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 		 708 aa  296  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 724 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.47 
 
 		 645 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  33.18 
 
 		 670 aa  289  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 		 655 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.1 
 
 		 647 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  32.06 
 
 		 646 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 		 671 aa  283  7.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 		 678 aa  283  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.8 
 
 		 639 aa  282  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  30.68 
 
 		 716 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 		 644 aa  275  3e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 		 645 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 		 646 aa  270  8.999999999999999e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 		 631 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  29.76 
 
 		 637 aa  268  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  30.29 
 
 		 661 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 		 664 aa  265  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14210  penicillin-binding protein 2  31.22 
 
 		 709 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 692 aa  264  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  31.21 
 
 		 602 aa  263  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  31.21 
 
 		 602 aa  263  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 		 629 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  31.34 
 
 		 663 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  31.34 
 
 		 669 aa  261  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  33.65 
 
 		 605 aa  259  9e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 		 642 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 		 640 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 		 662 aa  257  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 		 630 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 		 629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 		 640 aa  253  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 		 629 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.89 
 
 		 629 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  33.18 
 
 		 630 aa  253  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 		 626 aa  253  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  29.41 
 
 		 755 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.63 
 
 		 646 aa  251  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.74 
 
 		 586 aa  249  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  31.11 
 
 		 634 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.28 
 
 		 611 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  29.38 
 
 		 574 aa  249  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.84 
 
 		 618 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  29.35 
 
 		 802 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  29.35 
 
 		 802 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 		 631 aa  248  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 		 633 aa  247  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  29.35 
 
 		 802 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  29.35 
 
 		 802 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 		 631 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.38 
 
 		 658 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 		 631 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  30.7 
 
 		 632 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  31.57 
 
 		 634 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.1 
 
 		 631 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  30.76 
 
 		 629 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  31.37 
 
 		 631 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  29.35 
 
 		 803 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  29.35 
 
 		 809 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 		 641 aa  244  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  32.76 
 
 		 764 aa  243  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 		 775 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  30.33 
 
 		 630 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  30.75 
 
 		 625 aa  243  7.999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  31.16 
 
 		 629 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  29.14 
 
 		 610 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  30.61 
 
 		 641 aa  243  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  28.99 
 
 		 617 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  29.22 
 
 		 638 aa  242  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  30.42 
 
 		 619 aa  242  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 602 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  31.79 
 
 		 682 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  29.2 
 
 		 800 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 		 618 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 		 618 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 		 618 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 		 618 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 		 618 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  31.53 
 
 		 684 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  29.78 
 
 		 618 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  28.79 
 
 		 640 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  29.2 
 
 		 803 aa  241  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 		 618 aa  241  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  29.2 
 
 		 802 aa  240  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  33.05 
 
 		 775 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 		 623 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 		 623 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  29.29 
 
 		 618 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  29.1 
 
 		 760 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 		 765 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 		 765 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 		 632 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>