More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1373 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  57.12 
 
 		 548 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  100 
 
 		 609 aa  1249    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  57.14 
 
 		 615 aa  693    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0050  peptidoglycan glycosyltransferase  57.92 
 
 		 595 aa  676    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00491  putative penicillin-binding protein  61.23 
 
 		 600 aa  735    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0041  putative penicillin-binding protein  56.2 
 
 		 596 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.381944  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  97.87 
 
 		 609 aa  1224    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00431  putative penicillin-binding protein  63.26 
 
 		 602 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.689764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00431  putative penicillin-binding protein  58.03 
 
 		 548 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.876633  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00411  putative penicillin-binding protein  56.57 
 
 		 548 aa  650    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.563194  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  38.4 
 
 		 612 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  38.4 
 
 		 612 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  39.42 
 
 		 605 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  38.1 
 
 		 613 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  39.76 
 
 		 610 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  38.96 
 
 		 596 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  38.79 
 
 		 600 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 		 597 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  35.58 
 
 		 586 aa  292  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 		 664 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 		 662 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  31.17 
 
 		 630 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  32.04 
 
 		 629 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 		 629 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 		 607 aa  278  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  32.13 
 
 		 627 aa  278  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  31.84 
 
 		 629 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  30.33 
 
 		 637 aa  278  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.01 
 
 		 629 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32 
 
 		 636 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  33.66 
 
 		 646 aa  276  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 		 603 aa  274  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.85 
 
 		 639 aa  273  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  33.1 
 
 		 611 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.89 
 
 		 631 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  32.31 
 
 		 646 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.27 
 
 		 574 aa  269  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.18 
 
 		 632 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  31.97 
 
 		 655 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  30.59 
 
 		 646 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 		 678 aa  268  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 		 630 aa  267  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 		 643 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 609 aa  266  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  30.33 
 
 		 801 aa  266  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 		 671 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  32.13 
 
 		 629 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  31.97 
 
 		 646 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 673 aa  264  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 		 648 aa  264  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 		 703 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  32.76 
 
 		 631 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  31.8 
 
 		 629 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  30.28 
 
 		 599 aa  263  6.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 		 643 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  32.59 
 
 		 631 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 		 642 aa  261  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  30.57 
 
 		 793 aa  261  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 		 650 aa  261  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  31.24 
 
 		 652 aa  260  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  32.79 
 
 		 655 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  30.83 
 
 		 641 aa  258  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 		 667 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 		 645 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  32.45 
 
 		 631 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  31.59 
 
 		 802 aa  258  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  31.26 
 
 		 803 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  31.26 
 
 		 809 aa  257  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  29.82 
 
 		 638 aa  257  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 		 637 aa  257  5e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  30.31 
 
 		 766 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  31.26 
 
 		 802 aa  256  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  31.26 
 
 		 802 aa  256  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  30.17 
 
 		 610 aa  256  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  31.26 
 
 		 803 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  31.26 
 
 		 802 aa  256  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 618 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  31.26 
 
 		 802 aa  256  7e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.76 
 
 		 641 aa  256  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  30.28 
 
 		 679 aa  254  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 634 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.67 
 
 		 640 aa  253  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  31.47 
 
 		 681 aa  254  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  30.55 
 
 		 646 aa  253  7e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.53 
 
 		 645 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.96 
 
 		 647 aa  253  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  28.25 
 
 		 661 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  30.88 
 
 		 800 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 		 646 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  32.42 
 
 		 646 aa  251  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  30.46 
 
 		 775 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 		 618 aa  249  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  30.87 
 
 		 631 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  29.28 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 626 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  31.46 
 
 		 630 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  29.28 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.28 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.99 
 
 		 771 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>