More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0658 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
639 aa  1300    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  52.69 
 
 
634 aa  647    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  47.59 
 
 
634 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  42.67 
 
 
628 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 
648 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 
648 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  42.13 
 
 
647 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  41.51 
 
 
681 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  41.13 
 
 
647 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  41.45 
 
 
649 aa  462  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  41.04 
 
 
648 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  40.62 
 
 
648 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  40.88 
 
 
624 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  40.86 
 
 
662 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  39.43 
 
 
689 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  38.59 
 
 
636 aa  382  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  37.86 
 
 
658 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  38.56 
 
 
670 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  35.64 
 
 
645 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  35.88 
 
 
647 aa  362  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 
642 aa  361  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  36.41 
 
 
643 aa  360  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.24 
 
 
618 aa  359  9e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  39.08 
 
 
619 aa  359  9e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  35.97 
 
 
639 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  36.38 
 
 
634 aa  349  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  36.21 
 
 
602 aa  348  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  36.21 
 
 
602 aa  348  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  36.68 
 
 
646 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  36.46 
 
 
646 aa  340  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  35.15 
 
 
640 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 
636 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  36.39 
 
 
630 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  36.06 
 
 
629 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  35.93 
 
 
629 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  36.27 
 
 
629 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  35.93 
 
 
629 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  36.12 
 
 
631 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.12 
 
 
667 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  35.41 
 
 
611 aa  331  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  36.02 
 
 
655 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  36.96 
 
 
631 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  37.06 
 
 
627 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  35.35 
 
 
631 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  37.24 
 
 
631 aa  327  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  35.42 
 
 
609 aa  327  6e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  35.69 
 
 
630 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 
623 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 
623 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
646 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
623 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  35.17 
 
 
626 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  36.74 
 
 
629 aa  323  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  36.08 
 
 
630 aa  323  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 
623 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  36.8 
 
 
629 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 
641 aa  319  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 
623 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.69 
 
 
645 aa  317  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 
637 aa  314  3.9999999999999997e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  32.24 
 
 
618 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  32.4 
 
 
627 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.82 
 
 
633 aa  313  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 
610 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  32.08 
 
 
618 aa  312  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
643 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 
618 aa  312  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 
618 aa  312  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 
618 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 
618 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
618 aa  310  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  32.24 
 
 
618 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  32.24 
 
 
618 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  32.24 
 
 
618 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  32.24 
 
 
618 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  35.41 
 
 
630 aa  307  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.9 
 
 
574 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  33.77 
 
 
612 aa  306  7e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  33.39 
 
 
615 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 
602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 
607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  31.57 
 
 
586 aa  304  4.0000000000000003e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  32.9 
 
 
652 aa  303  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  32.4 
 
 
610 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  33.12 
 
 
802 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  32.96 
 
 
803 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.85 
 
 
636 aa  301  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 
764 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  35.06 
 
 
632 aa  301  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 
640 aa  300  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  33.01 
 
 
775 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  32.96 
 
 
809 aa  300  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  32.96 
 
 
803 aa  300  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  32.85 
 
 
802 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  32.85 
 
 
802 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 
761 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  32.85 
 
 
802 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  32.85 
 
 
802 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  33.01 
 
 
756 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 
767 aa  298  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>