More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2266 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  71.62 
 
 
603 aa  872    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  81.82 
 
 
590 aa  966    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  91.44 
 
 
604 aa  1068    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  81.82 
 
 
606 aa  967    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  81.99 
 
 
606 aa  987    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 
588 aa  1193    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  48.82 
 
 
608 aa  537  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  48.23 
 
 
612 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  41.04 
 
 
599 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  36.75 
 
 
644 aa  323  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.95 
 
 
586 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.95 
 
 
586 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.95 
 
 
586 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.85 
 
 
593 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.73 
 
 
585 aa  293  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  35.13 
 
 
580 aa  270  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  33.03 
 
 
633 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  31.07 
 
 
619 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 
625 aa  187  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.57 
 
 
507 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  31.8 
 
 
659 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  39.7 
 
 
512 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  32.86 
 
 
826 aa  173  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  28.87 
 
 
643 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  38.05 
 
 
540 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.86 
 
 
643 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  35.86 
 
 
543 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  34.06 
 
 
689 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  28.43 
 
 
689 aa  160  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.28 
 
 
636 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  27.02 
 
 
627 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  27.68 
 
 
661 aa  150  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  36.22 
 
 
608 aa  147  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.79 
 
 
639 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.63 
 
 
531 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.94 
 
 
645 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  29.33 
 
 
678 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.39 
 
 
563 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  25.16 
 
 
662 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.23 
 
 
664 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  27.17 
 
 
649 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 
535 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  35.03 
 
 
417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  28.57 
 
 
630 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
458 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  30.04 
 
 
649 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.04 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0349  penicillin-binding protein  24.65 
 
 
540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  32.6 
 
 
570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 
473 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  25.85 
 
 
648 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  25.85 
 
 
648 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  25.29 
 
 
648 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 
504 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 
480 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 
489 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  27.86 
 
 
551 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.29 
 
 
484 aa  104  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  32.49 
 
 
573 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
624 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  27.07 
 
 
524 aa  101  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  29.43 
 
 
471 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  28.68 
 
 
647 aa  101  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.49 
 
 
643 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 
648 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 
924 aa  100  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  28.81 
 
 
921 aa  100  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.44 
 
 
972 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 
647 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  28.27 
 
 
605 aa  99.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 
645 aa  99.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 
482 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 
470 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.95 
 
 
503 aa  99.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 
485 aa  98.2  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.98 
 
 
490 aa  97.8  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  27.43 
 
 
487 aa  97.8  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  25.29 
 
 
647 aa  97.8  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.36 
 
 
476 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  28.49 
 
 
596 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  27.14 
 
 
487 aa  97.1  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  26.97 
 
 
610 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  30.7 
 
 
489 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  22.42 
 
 
586 aa  96.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 
628 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  27.74 
 
 
485 aa  95.9  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  27.8 
 
 
636 aa  95.1  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  27.27 
 
 
598 aa  95.5  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 
483 aa  95.1  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.97 
 
 
822 aa  95.5  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  32.79 
 
 
560 aa  94.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.11 
 
 
704 aa  94  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.25 
 
 
547 aa  94  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 
485 aa  93.6  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  23.72 
 
 
607 aa  93.2  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  27.86 
 
 
639 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2533  penicillin-binding protein  21.03 
 
 
655 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0143777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.21 
 
 
559 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  26.33 
 
 
649 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  26.98 
 
 
597 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>