More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4600 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 639 aa  1243    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  50.45 
 
 		 659 aa  487  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  46.04 
 
 		 662 aa  481  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  44.48 
 
 		 664 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  51.84 
 
 		 649 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  45.66 
 
 		 645 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  43.79 
 
 		 661 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.58 
 
 		 636 aa  362  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.2 
 
 		 625 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  39.8 
 
 		 678 aa  278  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  37.7 
 
 		 619 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  37.82 
 
 		 633 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  42.4 
 
 		 540 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  41.14 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  29.46 
 
 		 643 aa  197  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  39.32 
 
 		 689 aa  196  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  33.92 
 
 		 580 aa  190  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.46 
 
 		 643 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.92 
 
 		 593 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  36.6 
 
 		 543 aa  180  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  37.98 
 
 		 826 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  40.52 
 
 		 608 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  31.71 
 
 		 599 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.11 
 
 		 606 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.66 
 
 		 586 aa  170  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.66 
 
 		 586 aa  170  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.66 
 
 		 586 aa  170  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.34 
 
 		 563 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.75 
 
 		 585 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.98 
 
 		 606 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.89 
 
 		 590 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.29 
 
 		 588 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  29.28 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  29.51 
 
 		 603 aa  156  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  31.48 
 
 		 630 aa  156  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  30.41 
 
 		 627 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  28.68 
 
 		 612 aa  154  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.97 
 
 		 512 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  30.24 
 
 		 689 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  37.25 
 
 		 644 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.06 
 
 		 604 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  38.68 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  33.08 
 
 		 573 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  33.98 
 
 		 570 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  28.1 
 
 		 639 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  27.98 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  27.61 
 
 		 645 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.1 
 
 		 531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  27.9 
 
 		 615 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  24.02 
 
 		 643 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  24.49 
 
 		 646 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  27.5 
 
 		 643 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  28.89 
 
 		 691 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  26.39 
 
 		 642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  26.69 
 
 		 647 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  28.02 
 
 		 640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  27.35 
 
 		 636 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  26.49 
 
 		 646 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  29.05 
 
 		 605 aa  110  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  29.67 
 
 		 597 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.01 
 
 		 476 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  28.6 
 
 		 648 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  28.6 
 
 		 648 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  28.94 
 
 		 473 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  27.49 
 
 		 609 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  27.06 
 
 		 646 aa  105  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  26.17 
 
 		 646 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00431  putative penicillin-binding protein  28.51 
 
 		 602 aa  104  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.689764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  24.25 
 
 		 647 aa  103  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 		 478 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  27.64 
 
 		 648 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  25.73 
 
 		 598 aa  103  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 		 662 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  25.28 
 
 		 657 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  31.82 
 
 		 596 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  27.32 
 
 		 689 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  31.9 
 
 		 487 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  27.37 
 
 		 609 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  26.99 
 
 		 632 aa  100  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 617 aa  99.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  23.6 
 
 		 640 aa  99.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  27.26 
 
 		 619 aa  100  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  25.56 
 
 		 634 aa  100  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  24.78 
 
 		 645 aa  100  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  27.29 
 
 		 648 aa  99.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  27.22 
 
 		 602 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 		 615 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 		 605 aa  99.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  27.6 
 
 		 600 aa  99  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  31.99 
 
 		 487 aa  99.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  27.22 
 
 		 602 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 489 aa  99.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  31.56 
 
 		 647 aa  98.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 		 470 aa  98.2  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  24.16 
 
 		 610 aa  97.8  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  25.18 
 
 		 586 aa  97.8  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  28.83 
 
 		 646 aa  97.8  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 		 609 aa  97.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 485 aa  97.1  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>