More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3641 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 563 aa  1112    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  39.51 
 
 		 689 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  42.31 
 
 		 507 aa  273  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  42.9 
 
 		 619 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  42.07 
 
 		 540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.79 
 
 		 543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  38.45 
 
 		 826 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  35.36 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.21 
 
 		 664 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  39.6 
 
 		 659 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  43.3 
 
 		 678 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  39.27 
 
 		 662 aa  198  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  38.98 
 
 		 649 aa  196  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  40.84 
 
 		 633 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.8 
 
 		 531 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.9 
 
 		 636 aa  190  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  39.37 
 
 		 661 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.48 
 
 		 586 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.48 
 
 		 586 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.48 
 
 		 586 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.46 
 
 		 625 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.78 
 
 		 645 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.34 
 
 		 639 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  35.9 
 
 		 643 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  40.11 
 
 		 599 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  38.07 
 
 		 603 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  37.12 
 
 		 580 aa  167  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  38.55 
 
 		 644 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.97 
 
 		 606 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.94 
 
 		 593 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  35.38 
 
 		 608 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.79 
 
 		 585 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.97 
 
 		 590 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.97 
 
 		 606 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.75 
 
 		 643 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  38.19 
 
 		 570 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  41.79 
 
 		 612 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  33.74 
 
 		 482 aa  150  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.39 
 
 		 588 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  35.44 
 
 		 573 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.1 
 
 		 604 aa  144  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  31.5 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  30.71 
 
 		 646 aa  140  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  36.14 
 
 		 689 aa  140  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  31.98 
 
 		 470 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 		 458 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  30.8 
 
 		 615 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  28.43 
 
 		 610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  35.33 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  32.85 
 
 		 487 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  34.15 
 
 		 489 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  32.76 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  35.08 
 
 		 590 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  27.59 
 
 		 557 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.96 
 
 		 643 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  29.82 
 
 		 972 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.04 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 		 603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.61 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  33.42 
 
 		 627 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  28.94 
 
 		 639 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  32.16 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.37 
 
 		 645 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  28.25 
 
 		 647 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  30.25 
 
 		 596 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  27.36 
 
 		 557 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.59 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  28.88 
 
 		 647 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  35.96 
 
 		 630 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 597 aa  124  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  29.81 
 
 		 610 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 		 643 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  32.96 
 
 		 612 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2144  penicillin-binding protein 2, putative  29.74 
 
 		 636 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  32.96 
 
 		 612 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1802  penicillin-binding protein 2  29.74 
 
 		 636 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  26.87 
 
 		 574 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0050  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 595 aa  121  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.75 
 
 		 490 aa  120  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.89 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  27.41 
 
 		 640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 		 491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 		 491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  28.85 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 		 491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 609 aa  117  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.22 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  28.5 
 
 		 605 aa  117  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.41 
 
 		 493 aa  117  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  27.3 
 
 		 600 aa  116  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  29.98 
 
 		 667 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  32.29 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  28.5 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 		 636 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>