More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00471 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_00411  putative penicillin-binding protein  78.47 
 
 
548 aa  915    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.563194  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00431  putative penicillin-binding protein  80.47 
 
 
548 aa  924    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.876633  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  57.12 
 
 
609 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00431  putative penicillin-binding protein  58.9 
 
 
602 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.689764  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  100 
 
 
548 aa  1119    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0041  putative penicillin-binding protein  79.89 
 
 
596 aa  925    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.381944  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  56.75 
 
 
609 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00491  putative penicillin-binding protein  54.93 
 
 
600 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0050  peptidoglycan glycosyltransferase  54.03 
 
 
595 aa  631  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  52.55 
 
 
615 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  39.34 
 
 
613 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  38.05 
 
 
596 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  38.07 
 
 
610 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  38.12 
 
 
600 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 
605 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  38.88 
 
 
612 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  38.88 
 
 
612 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  35.27 
 
 
603 aa  300  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  33.75 
 
 
610 aa  292  9e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  35.47 
 
 
586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 
597 aa  279  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  32.62 
 
 
647 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  32.5 
 
 
646 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  32.8 
 
 
640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 
643 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 
662 aa  273  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 
650 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  32.75 
 
 
639 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 
664 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  31.61 
 
 
641 aa  266  8e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 
703 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 
609 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.28 
 
 
611 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.81 
 
 
646 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  31.4 
 
 
648 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 
678 aa  264  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 
643 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.92 
 
 
629 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  31.21 
 
 
629 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 
630 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  31.34 
 
 
629 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  31.54 
 
 
638 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  31.34 
 
 
629 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 
646 aa  260  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  30.88 
 
 
646 aa  259  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  30.36 
 
 
646 aa  259  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.78 
 
 
645 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 
673 aa  258  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  33.52 
 
 
634 aa  257  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  30.86 
 
 
631 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.37 
 
 
641 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  32.38 
 
 
615 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
631 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
645 aa  254  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.84 
 
 
636 aa  253  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.57 
 
 
647 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
634 aa  253  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 
646 aa  253  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  28.85 
 
 
679 aa  253  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.16 
 
 
646 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.23 
 
 
642 aa  253  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  30.61 
 
 
637 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  30.47 
 
 
629 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
633 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 
671 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
629 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.72 
 
 
631 aa  252  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.26 
 
 
771 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  30.72 
 
 
803 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  31.81 
 
 
630 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 
767 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
683 aa  250  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  29.69 
 
 
617 aa  250  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  29.79 
 
 
617 aa  250  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  29.9 
 
 
655 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  31.69 
 
 
574 aa  249  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 
802 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 
802 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  30.09 
 
 
800 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 
802 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 
802 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  32.17 
 
 
638 aa  249  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  29.93 
 
 
652 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  30.78 
 
 
802 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  31.17 
 
 
636 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  29.14 
 
 
640 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
640 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  30.55 
 
 
803 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  30.55 
 
 
809 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  30.94 
 
 
643 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
637 aa  248  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  31.98 
 
 
588 aa  248  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  27.99 
 
 
793 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  28.08 
 
 
766 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  31.34 
 
 
634 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 
607 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  30.74 
 
 
619 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 
756 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 
775 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 
691 aa  243  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>