More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12880 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  70.18 
 
 		 606 aa  880    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  71.79 
 
 		 604 aa  849    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  71.26 
 
 		 590 aa  854    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  100 
 
 		 603 aa  1223    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  70.35 
 
 		 606 aa  863    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  71.62 
 
 		 588 aa  857    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  48.48 
 
 		 608 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  45.03 
 
 		 612 aa  458  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  41.1 
 
 		 599 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.16 
 
 		 586 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.16 
 
 		 586 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.16 
 
 		 586 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.09 
 
 		 593 aa  302  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  36.27 
 
 		 644 aa  297  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.17 
 
 		 585 aa  296  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  37.36 
 
 		 580 aa  286  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  34.55 
 
 		 633 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  31.8 
 
 		 619 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  30.46 
 
 		 659 aa  193  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.55 
 
 		 625 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  32.86 
 
 		 543 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  29.26 
 
 		 689 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  29.95 
 
 		 689 aa  173  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  40.42 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  40.91 
 
 		 540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.55 
 
 		 507 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.21 
 
 		 636 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.58 
 
 		 643 aa  165  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  30.51 
 
 		 826 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.99 
 
 		 645 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  27.23 
 
 		 643 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.67 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.54 
 
 		 664 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  26.41 
 
 		 662 aa  147  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.29 
 
 		 531 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  35.56 
 
 		 608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  28.08 
 
 		 661 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.1 
 
 		 639 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  30.55 
 
 		 678 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  27.29 
 
 		 627 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  27.02 
 
 		 649 aa  132  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  35.81 
 
 		 570 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  28.55 
 
 		 630 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  34.34 
 
 		 417 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  27 
 
 		 648 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  27 
 
 		 648 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 		 535 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 		 458 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 		 485 aa  113  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  33.75 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 		 649 aa  112  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  33.12 
 
 		 480 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  29.08 
 
 		 487 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  33.64 
 
 		 504 aa  109  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  28.78 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  27.41 
 
 		 574 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.79 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0349  penicillin-binding protein  23.91 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  35.59 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  25.63 
 
 		 648 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  34.09 
 
 		 560 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  27.79 
 
 		 598 aa  104  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 		 483 aa  104  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  29.8 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  28.27 
 
 		 597 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 		 624 aa  104  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.38 
 
 		 547 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  30.12 
 
 		 972 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  29.54 
 
 		 605 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 482 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  30.31 
 
 		 933 aa  101  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.34 
 
 		 484 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  29.74 
 
 		 636 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 		 490 aa  101  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.71 
 
 		 645 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  27.83 
 
 		 551 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.71 
 
 		 647 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  27.25 
 
 		 610 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  29.43 
 
 		 586 aa  99.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  26.65 
 
 		 524 aa  96.7  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.04 
 
 		 704 aa  96.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 		 461 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  25.68 
 
 		 648 aa  96.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  27.45 
 
 		 646 aa  96.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 		 559 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  31.29 
 
 		 921 aa  95.9  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  29.09 
 
 		 647 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  29.09 
 
 		 647 aa  95.9  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 		 643 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 		 549 aa  95.1  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.12 
 
 		 822 aa  95.1  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  27.84 
 
 		 603 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  28.96 
 
 		 485 aa  94.7  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.88 
 
 		 642 aa  94  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  26.95 
 
 		 643 aa  94  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  27.03 
 
 		 646 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>