More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0020 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
489 aa  988    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  55.76 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.86 
 
 
483 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  54.4 
 
 
483 aa  495  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.8 
 
 
493 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  47.34 
 
 
485 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.66 
 
 
485 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  47.45 
 
 
482 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.92 
 
 
480 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  46.46 
 
 
490 aa  395  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.53 
 
 
485 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  44.67 
 
 
491 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  44.44 
 
 
491 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  45.51 
 
 
480 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  44.44 
 
 
491 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  44.44 
 
 
491 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  44.27 
 
 
491 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  43.69 
 
 
488 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.97 
 
 
481 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  42.34 
 
 
489 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  42.63 
 
 
485 aa  364  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.54 
 
 
493 aa  363  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.26 
 
 
484 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.56 
 
 
488 aa  356  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  44.27 
 
 
491 aa  353  5e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  39.88 
 
 
488 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  40.68 
 
 
495 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  39.53 
 
 
504 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.22 
 
 
487 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.39 
 
 
481 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  38.23 
 
 
490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 
486 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  40.93 
 
 
482 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 
486 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  39.16 
 
 
504 aa  292  9e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  37.99 
 
 
501 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  38.01 
 
 
503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 
473 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.71 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  37.37 
 
 
461 aa  261  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.35 
 
 
490 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.13 
 
 
478 aa  259  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.76 
 
 
547 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  33.4 
 
 
492 aa  253  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  32.67 
 
 
470 aa  246  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.99 
 
 
503 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.73 
 
 
476 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  33.8 
 
 
471 aa  242  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  34.9 
 
 
489 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 
458 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.48 
 
 
573 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 
570 aa  236  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  36.23 
 
 
584 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  34.07 
 
 
933 aa  232  9e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
472 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.85 
 
 
972 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.24 
 
 
924 aa  219  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  33.07 
 
 
921 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  31.32 
 
 
579 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 
577 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  35.32 
 
 
645 aa  204  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.86 
 
 
633 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  36.75 
 
 
578 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  31.24 
 
 
487 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  31.1 
 
 
487 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  34.25 
 
 
611 aa  200  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.53 
 
 
574 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  32.98 
 
 
646 aa  193  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  33.82 
 
 
646 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  32.32 
 
 
630 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 
643 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.02 
 
 
640 aa  187  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.35 
 
 
629 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 
630 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 
646 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  34.52 
 
 
631 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  32.56 
 
 
629 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 
629 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.98 
 
 
645 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  34.36 
 
 
631 aa  183  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 
647 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 
673 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 
631 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 
609 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.89 
 
 
610 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  31.66 
 
 
629 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.9 
 
 
639 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 
723 aa  181  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.87 
 
 
636 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  36.36 
 
 
800 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 
662 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
678 aa  177  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  35.92 
 
 
641 aa  177  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 
954 aa  176  7e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
630 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  29.91 
 
 
701 aa  176  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.41 
 
 
767 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  35.54 
 
 
627 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 
664 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 
646 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>