More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5826 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
590 aa  1172    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  48.06 
 
 
570 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  46.91 
 
 
573 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  43.03 
 
 
417 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  28.65 
 
 
543 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  32.59 
 
 
507 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  32.94 
 
 
540 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  33.96 
 
 
689 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  37.3 
 
 
619 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  30.7 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  34.23 
 
 
826 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  33.98 
 
 
608 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.77 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.33 
 
 
563 aa  110  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.11 
 
 
586 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.11 
 
 
586 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.11 
 
 
586 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.02 
 
 
645 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  33.53 
 
 
659 aa  107  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  34.39 
 
 
580 aa  103  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.36 
 
 
625 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.03 
 
 
636 aa  102  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.65 
 
 
585 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  32.1 
 
 
661 aa  99.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  32.01 
 
 
644 aa  99.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.88 
 
 
664 aa  97.1  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 
491 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 
491 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 
491 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  33.44 
 
 
608 aa  95.5  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  31.12 
 
 
560 aa  94.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  32.8 
 
 
603 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  31.29 
 
 
649 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  33.01 
 
 
531 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.87 
 
 
491 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  30.68 
 
 
662 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  30.94 
 
 
495 aa  90.5  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 
473 aa  90.1  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  33.88 
 
 
633 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 
489 aa  89  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.48 
 
 
639 aa  88.2  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.31 
 
 
606 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.19 
 
 
481 aa  86.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  31.23 
 
 
599 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.11 
 
 
491 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 
493 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 
480 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.37 
 
 
590 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  25.94 
 
 
503 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  27.95 
 
 
657 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.37 
 
 
606 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  30.49 
 
 
491 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  27.41 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  28.81 
 
 
504 aa  81.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.94 
 
 
604 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.52 
 
 
487 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 
493 aa  78.2  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.23 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  28.57 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 
482 aa  77  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.17 
 
 
476 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.51 
 
 
588 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  30.53 
 
 
933 aa  74.7  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  28.18 
 
 
490 aa  74.7  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4186  penicillin-binding protein transpeptidase  30.7 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  29.33 
 
 
689 aa  74.3  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4043  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.65 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4159  penicillin-binding protein transpeptidase  30.7 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  27.91 
 
 
643 aa  73.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  32.01 
 
 
678 aa  73.9  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  28.12 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  31.75 
 
 
630 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  30.75 
 
 
485 aa  73.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  28.16 
 
 
584 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  27.97 
 
 
485 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  28.74 
 
 
493 aa  72  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  26.25 
 
 
723 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.82 
 
 
549 aa  71.6  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.41 
 
 
485 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  30.51 
 
 
716 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  28.91 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  26.53 
 
 
535 aa  70.1  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  26.81 
 
 
492 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  28.61 
 
 
577 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 
501 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.15 
 
 
503 aa  69.3  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  29.53 
 
 
716 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  30.85 
 
 
612 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1104  penicillin-binding protein transpeptidase  34.42 
 
 
600 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  27.69 
 
 
775 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 
480 aa  68.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  27.44 
 
 
570 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  29.87 
 
 
716 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  29.87 
 
 
716 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>