More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1727 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
540 aa  1077    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  62.06 
 
 
543 aa  641    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  47.67 
 
 
507 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  44.3 
 
 
689 aa  405  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  42.94 
 
 
826 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.25 
 
 
512 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  41.37 
 
 
608 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  45.28 
 
 
619 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.42 
 
 
563 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  32.2 
 
 
643 aa  250  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  39.53 
 
 
531 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  43.05 
 
 
678 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  42.4 
 
 
639 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  38.42 
 
 
633 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  34.21 
 
 
599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  42.73 
 
 
580 aa  198  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.19 
 
 
636 aa  196  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.9 
 
 
645 aa  193  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  31.47 
 
 
608 aa  193  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  38.18 
 
 
661 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.34 
 
 
625 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.51 
 
 
664 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  38.56 
 
 
659 aa  190  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.23 
 
 
606 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  40.37 
 
 
644 aa  183  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.77 
 
 
604 aa  183  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  40.95 
 
 
603 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.43 
 
 
588 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.1 
 
 
593 aa  180  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.23 
 
 
590 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.23 
 
 
606 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  35.51 
 
 
662 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.18 
 
 
586 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.18 
 
 
586 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.18 
 
 
586 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  33.15 
 
 
570 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  32.36 
 
 
573 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  32.82 
 
 
560 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  37.6 
 
 
649 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  35 
 
 
476 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  38.41 
 
 
417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.78 
 
 
585 aa  163  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  35.08 
 
 
627 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  37.47 
 
 
630 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 
473 aa  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.46 
 
 
643 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  36.58 
 
 
689 aa  150  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  41.89 
 
 
612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 
458 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  31.89 
 
 
487 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 
503 aa  144  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  28.38 
 
 
640 aa  143  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  26.5 
 
 
646 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.11 
 
 
609 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  36.93 
 
 
480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  31.63 
 
 
487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  26.75 
 
 
610 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  38.14 
 
 
590 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  33.76 
 
 
485 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  27.98 
 
 
470 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 
482 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1104  penicillin-binding protein transpeptidase  31.43 
 
 
600 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.93 
 
 
504 aa  134  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 
485 aa  133  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  25.92 
 
 
643 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.75 
 
 
636 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 
611 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.47 
 
 
645 aa  130  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  31.99 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 
603 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 
645 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  32.24 
 
 
535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  28.91 
 
 
643 aa  128  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 
493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  28.94 
 
 
646 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 
472 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.04 
 
 
480 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.1 
 
 
647 aa  127  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  30.79 
 
 
972 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  30.27 
 
 
596 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  27.01 
 
 
647 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.24 
 
 
485 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  28.67 
 
 
471 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 
489 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  27.75 
 
 
632 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  29.91 
 
 
605 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.89 
 
 
487 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  28.43 
 
 
597 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  32.88 
 
 
489 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  30.18 
 
 
551 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  29.56 
 
 
647 aa  124  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 
482 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  25.77 
 
 
607 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  27.9 
 
 
557 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.38 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.79 
 
 
478 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.73 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  27.38 
 
 
557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  32.01 
 
 
504 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 
490 aa  121  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>