More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1690 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 612 aa  1217    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  48.23 
 
 		 588 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.33 
 
 		 606 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  45.03 
 
 		 603 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.33 
 
 		 606 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.55 
 
 		 590 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  47.03 
 
 		 604 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  45.58 
 
 		 608 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  37.99 
 
 		 599 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  35.54 
 
 		 644 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.58 
 
 		 586 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.58 
 
 		 586 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.58 
 
 		 586 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  36.83 
 
 		 580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.69 
 
 		 593 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.98 
 
 		 585 aa  257  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  32.83 
 
 		 633 aa  234  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  31.19 
 
 		 619 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.28 
 
 		 625 aa  183  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  30.85 
 
 		 689 aa  174  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  39.01 
 
 		 507 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  38.86 
 
 		 608 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  32.33 
 
 		 659 aa  160  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  32.01 
 
 		 540 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  29.86 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  29.21 
 
 		 826 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.99 
 
 		 563 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.78 
 
 		 512 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.17 
 
 		 639 aa  145  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.91 
 
 		 664 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  27.56 
 
 		 689 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  29.06 
 
 		 678 aa  136  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  29.48 
 
 		 643 aa  134  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  40.86 
 
 		 531 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  27.7 
 
 		 661 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.17 
 
 		 643 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  28.55 
 
 		 630 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.71 
 
 		 822 aa  124  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  27.99 
 
 		 649 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.2 
 
 		 636 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  26.09 
 
 		 662 aa  122  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  26.77 
 
 		 627 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.59 
 
 		 645 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 		 485 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0349  penicillin-binding protein  26.31 
 
 		 540 aa  116  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  27.6 
 
 		 524 aa  114  5e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  34.94 
 
 		 586 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  34.53 
 
 		 570 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  28.95 
 
 		 649 aa  113  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 		 470 aa  113  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.1 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.56 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  29.55 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  29.97 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  33.12 
 
 		 417 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  28.91 
 
 		 600 aa  109  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 		 480 aa  109  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 		 473 aa  109  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  25.45 
 
 		 598 aa  108  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  29.97 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.97 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  28.65 
 
 		 972 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 		 458 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  26.7 
 
 		 648 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  26.7 
 
 		 648 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.75 
 
 		 490 aa  106  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 689 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  26.98 
 
 		 639 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 		 503 aa  105  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 		 603 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 		 485 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 		 643 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 		 648 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  26.94 
 
 		 586 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  30.16 
 
 		 489 aa  101  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 		 483 aa  101  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  27.2 
 
 		 646 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 		 504 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  28.98 
 
 		 535 aa  99.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.6 
 
 		 633 aa  99  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.44 
 
 		 472 aa  98.2  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 		 924 aa  97.8  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  26.3 
 
 		 628 aa  96.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  33.81 
 
 		 573 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 		 662 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 		 483 aa  95.1  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  29.79 
 
 		 647 aa  94.7  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  26.67 
 
 		 648 aa  94.4  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2144  penicillin-binding protein 2, putative  27.27 
 
 		 636 aa  94  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  25.36 
 
 		 574 aa  94  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1802  penicillin-binding protein 2  27.27 
 
 		 636 aa  94  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  27.25 
 
 		 646 aa  94  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  27.03 
 
 		 636 aa  94  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  24.88 
 
 		 640 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.12 
 
 		 481 aa  93.2  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 		 597 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  28.95 
 
 		 634 aa  93.6  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>