More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3275 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 661 aa  1305    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  49.91 
 
 		 659 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  50.09 
 
 		 649 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  46.86 
 
 		 645 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  44.38 
 
 		 662 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  45.56 
 
 		 664 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  44.68 
 
 		 639 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40 
 
 		 636 aa  331  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.51 
 
 		 625 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  35.55 
 
 		 619 aa  253  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  33.33 
 
 		 633 aa  246  9e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  36.98 
 
 		 678 aa  227  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.72 
 
 		 593 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.01 
 
 		 585 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.6 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  37.63 
 
 		 689 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.6 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.6 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  30.62 
 
 		 599 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  30.56 
 
 		 580 aa  175  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  28.21 
 
 		 643 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  32.89 
 
 		 543 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  36.9 
 
 		 540 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.14 
 
 		 507 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  33.14 
 
 		 689 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  36.62 
 
 		 826 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.57 
 
 		 608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.54 
 
 		 643 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.51 
 
 		 563 aa  160  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  32.34 
 
 		 630 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.97 
 
 		 606 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.31 
 
 		 604 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.02 
 
 		 606 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  28.08 
 
 		 603 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.15 
 
 		 590 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.68 
 
 		 588 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  35.83 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  28.22 
 
 		 627 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  27.71 
 
 		 644 aa  130  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  34.71 
 
 		 570 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  27.02 
 
 		 648 aa  123  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  32.39 
 
 		 573 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  27.51 
 
 		 608 aa  120  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  27.26 
 
 		 640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  27.83 
 
 		 603 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 		 660 aa  113  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  34.14 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  27.7 
 
 		 612 aa  112  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  27.15 
 
 		 609 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  26.06 
 
 		 610 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.44 
 
 		 472 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  26.84 
 
 		 597 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  25.95 
 
 		 689 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  34.62 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  25.49 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  25.64 
 
 		 636 aa  100  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  28.64 
 
 		 487 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  24.53 
 
 		 639 aa  100  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  27.39 
 
 		 615 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  27.34 
 
 		 547 aa  99.8  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  27.05 
 
 		 646 aa  99.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  26.35 
 
 		 645 aa  99.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  28.39 
 
 		 487 aa  99.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  25.44 
 
 		 647 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  27.65 
 
 		 600 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  26.69 
 
 		 619 aa  98.2  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  27.37 
 
 		 598 aa  97.8  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  32.03 
 
 		 590 aa  97.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  26.29 
 
 		 634 aa  97.4  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  23.22 
 
 		 608 aa  97.1  9e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  30.17 
 
 		 492 aa  96.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4064  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.36 
 
 		 765 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  27.34 
 
 		 600 aa  95.5  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  23.85 
 
 		 608 aa  94.7  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  26.14 
 
 		 646 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2521  penicillin-binding protein 2'  21.74 
 
 		 668 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00245242  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  24.6 
 
 		 524 aa  92.8  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0029  peptidoglycan glycosyltransferase  21.74 
 
 		 668 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0029  peptidoglycan glycosyltransferase  21.74 
 
 		 668 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  23.38 
 
 		 548 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  28.05 
 
 		 473 aa  92  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  28.21 
 
 		 622 aa  91.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 		 485 aa  91.3  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  25.91 
 
 		 647 aa  90.9  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  24.24 
 
 		 691 aa  91.3  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  28.24 
 
 		 662 aa  90.9  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.27 
 
 		 504 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 485 aa  90.1  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  26.87 
 
 		 605 aa  89.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  27.02 
 
 		 643 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  27.21 
 
 		 601 aa  90.1  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  26.98 
 
 		 599 aa  89  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  26.28 
 
 		 636 aa  89.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 		 482 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  26.16 
 
 		 724 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  26.98 
 
 		 601 aa  88.6  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  28.01 
 
 		 972 aa  88.2  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0050  peptidoglycan glycosyltransferase  27.03 
 
 		 595 aa  87.8  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.98 
 
 		 503 aa  88.2  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 		 485 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>