More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2030 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  70.18 
 
 
603 aa  880    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 
606 aa  1227    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  99.66 
 
 
590 aa  1191    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  99.83 
 
 
606 aa  1225    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  81.99 
 
 
588 aa  971    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  80.79 
 
 
604 aa  945    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  49.34 
 
 
608 aa  538  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  46.33 
 
 
612 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  42.31 
 
 
599 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  37.7 
 
 
644 aa  324  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.3 
 
 
586 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.3 
 
 
586 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.3 
 
 
586 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.01 
 
 
593 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.12 
 
 
585 aa  300  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  37.84 
 
 
580 aa  272  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  34.61 
 
 
633 aa  254  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  31.59 
 
 
619 aa  201  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  30.66 
 
 
689 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  31.83 
 
 
659 aa  187  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.29 
 
 
507 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  29.92 
 
 
689 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.13 
 
 
643 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  41.62 
 
 
512 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.2 
 
 
625 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  32.06 
 
 
826 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  41.2 
 
 
540 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  39.33 
 
 
543 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  29.8 
 
 
643 aa  164  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.69 
 
 
636 aa  161  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  28.39 
 
 
627 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  27.97 
 
 
661 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.5 
 
 
608 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.02 
 
 
639 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.61 
 
 
531 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  31.35 
 
 
678 aa  140  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.04 
 
 
645 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.67 
 
 
563 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  30.69 
 
 
630 aa  134  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.23 
 
 
664 aa  134  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  25.04 
 
 
662 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  29.17 
 
 
649 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0349  penicillin-binding protein  24.64 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  35.71 
 
 
417 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  27.02 
 
 
648 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  27.02 
 
 
648 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  34.5 
 
 
570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 
473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  26.97 
 
 
648 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  29.55 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.27 
 
 
504 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  31.33 
 
 
482 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  33.65 
 
 
480 aa  112  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.23 
 
 
490 aa  110  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  28.98 
 
 
649 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.26 
 
 
485 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 
470 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 
485 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  33.85 
 
 
573 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.58 
 
 
476 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  26.98 
 
 
524 aa  103  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.33 
 
 
489 aa  103  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  29.34 
 
 
471 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  26.75 
 
 
624 aa  101  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.66 
 
 
503 aa  101  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  25.37 
 
 
551 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  27.67 
 
 
643 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.93 
 
 
628 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  31.65 
 
 
489 aa  99  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 
553 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.59 
 
 
483 aa  99.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  27.42 
 
 
597 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.63 
 
 
647 aa  97.8  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 
484 aa  97.8  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.63 
 
 
645 aa  97.8  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  30.09 
 
 
933 aa  97.1  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  26.39 
 
 
646 aa  96.3  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  24.61 
 
 
648 aa  96.3  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.89 
 
 
822 aa  97.1  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  27.82 
 
 
972 aa  96.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  24.04 
 
 
586 aa  95.5  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  27.03 
 
 
603 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  29.33 
 
 
605 aa  95.5  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  28.25 
 
 
598 aa  94.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  25.23 
 
 
630 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 
924 aa  94.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  27.01 
 
 
610 aa  94.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 
485 aa  94  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  25.22 
 
 
647 aa  94.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  27.41 
 
 
636 aa  94.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  25.28 
 
 
634 aa  94  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  29.11 
 
 
921 aa  94  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  27.27 
 
 
647 aa  93.2  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  26.6 
 
 
619 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  27 
 
 
487 aa  93.6  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  26.58 
 
 
640 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 
461 aa  92.8  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.2 
 
 
633 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.11 
 
 
704 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>