More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2080 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 585 aa  1140    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  82.96 
 
 		 593 aa  912    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.34 
 
 		 586 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.34 
 
 		 586 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.34 
 
 		 586 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  45.77 
 
 		 580 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  42.16 
 
 		 599 aa  363  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.53 
 
 		 606 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  36.72 
 
 		 603 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.7 
 
 		 606 aa  309  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.7 
 
 		 590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.16 
 
 		 588 aa  306  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.73 
 
 		 604 aa  306  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  35.31 
 
 		 608 aa  274  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  36.21 
 
 		 644 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  35.11 
 
 		 612 aa  262  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  35.02 
 
 		 633 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0349  penicillin-binding protein  30.57 
 
 		 540 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  36.3 
 
 		 619 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.15 
 
 		 625 aa  201  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  33.84 
 
 		 661 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  31.55 
 
 		 662 aa  191  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.12 
 
 		 636 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  31 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.69 
 
 		 664 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 		 645 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  42.14 
 
 		 608 aa  170  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  31.65 
 
 		 659 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  40.85 
 
 		 507 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  33.45 
 
 		 649 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4485  NTF2 domain protein transpeptidase  29.91 
 
 		 559 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  41.75 
 
 		 540 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.75 
 
 		 639 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  41.58 
 
 		 512 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  37.17 
 
 		 689 aa  148  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.05 
 
 		 563 aa  147  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  34.63 
 
 		 678 aa  143  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  42.65 
 
 		 531 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  36.55 
 
 		 570 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  28.09 
 
 		 689 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  35.92 
 
 		 573 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  34.84 
 
 		 826 aa  127  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  31.82 
 
 		 643 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  27.04 
 
 		 627 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  27.55 
 
 		 630 aa  120  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  28.29 
 
 		 471 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.96 
 
 		 643 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.54 
 
 		 478 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  30.31 
 
 		 492 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  29.87 
 
 		 487 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  32.59 
 
 		 590 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.87 
 
 		 487 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  32.43 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  32.88 
 
 		 417 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  27.76 
 
 		 649 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 		 489 aa  99.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 		 458 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.3 
 
 		 481 aa  97.1  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 485 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  27.76 
 
 		 972 aa  95.1  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  29.02 
 
 		 639 aa  94.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  24.32 
 
 		 646 aa  94  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2250  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 		 606 aa  94  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 		 597 aa  93.6  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.01 
 
 		 547 aa  93.2  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  27.7 
 
 		 535 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.21 
 
 		 485 aa  92.8  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 		 648 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  28.71 
 
 		 473 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 		 648 aa  92.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 		 660 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 		 648 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 		 493 aa  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  28.61 
 
 		 646 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.5 
 
 		 472 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.75 
 
 		 490 aa  89.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  32.37 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 		 504 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.98 
 
 		 503 aa  89.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  28.49 
 
 		 603 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  24.44 
 
 		 551 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  30.03 
 
 		 489 aa  88.6  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.4 
 
 		 822 aa  88.6  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  25.26 
 
 		 636 aa  87.8  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 487 aa  88.2  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 		 484 aa  87.8  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 		 630 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 470 aa  87  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 		 482 aa  87  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 		 480 aa  86.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.05 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  24.04 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  27.78 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.74 
 
 		 954 aa  85.5  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  31.53 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  24.91 
 
 		 645 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 549 aa  84.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 		 648 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  27.59 
 
 		 632 aa  84.3  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>