More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00380 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  100 
 
 		 489 aa  995    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  54.55 
 
 		 491 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  54.55 
 
 		 491 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  54.55 
 
 		 491 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  53.85 
 
 		 491 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  52.85 
 
 		 491 aa  498  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.73 
 
 		 493 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.55 
 
 		 488 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  50.3 
 
 		 504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  50.1 
 
 		 491 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  50.1 
 
 		 495 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.7 
 
 		 480 aa  412  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  46.57 
 
 		 485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.86 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.23 
 
 		 483 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  45 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  43.7 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  44.92 
 
 		 482 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.6 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.31 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  44.81 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.34 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  44.58 
 
 		 489 aa  362  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  43.2 
 
 		 503 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  42.35 
 
 		 501 aa  350  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  43.29 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.62 
 
 		 487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.41 
 
 		 490 aa  317  4e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  41.35 
 
 		 490 aa  315  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  40.36 
 
 		 482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.2 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  38.83 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  38 
 
 		 492 aa  303  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  39 
 
 		 488 aa  298  1e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.06 
 
 		 481 aa  295  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.48 
 
 		 490 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.52 
 
 		 486 aa  279  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.52 
 
 		 486 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  37.4 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 473 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.46 
 
 		 458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  35.94 
 
 		 489 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  33.4 
 
 		 471 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  36.51 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 		 570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.53 
 
 		 476 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  34.84 
 
 		 933 aa  216  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  35.32 
 
 		 584 aa  209  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 		 461 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  32.36 
 
 		 972 aa  203  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  33.27 
 
 		 487 aa  200  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  35.33 
 
 		 578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  33.06 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 		 503 aa  197  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.41 
 
 		 924 aa  190  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 		 577 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.57 
 
 		 639 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 547 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.68 
 
 		 647 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.99 
 
 		 645 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  31.26 
 
 		 921 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 		 643 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.41 
 
 		 642 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 636 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  28.25 
 
 		 579 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  30.92 
 
 		 701 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  28.7 
 
 		 557 aa  160  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  32.25 
 
 		 535 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 632 aa  157  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  29.09 
 
 		 557 aa  156  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  33.75 
 
 		 673 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  30.84 
 
 		 611 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.59 
 
 		 640 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  32.75 
 
 		 610 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 645 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.25 
 
 		 633 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  30.48 
 
 		 626 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 		 631 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  31.77 
 
 		 640 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 		 631 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 		 636 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.47 
 
 		 631 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  28.5 
 
 		 617 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.81 
 
 		 954 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 		 630 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  29.43 
 
 		 634 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 		 709 aa  148  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  30.53 
 
 		 646 aa  147  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 		 619 aa  147  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  29.93 
 
 		 600 aa  147  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 646 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  28.01 
 
 		 617 aa  146  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  28.54 
 
 		 574 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.11 
 
 		 629 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 		 662 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 		 602 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>