More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0079 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
493 aa  990    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  52.73 
 
 
489 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  52.92 
 
 
491 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  51.61 
 
 
491 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  51.61 
 
 
491 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  51.61 
 
 
491 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  51.02 
 
 
491 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  50.81 
 
 
491 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.78 
 
 
488 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  47.02 
 
 
504 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  45.91 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  46.95 
 
 
485 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.53 
 
 
483 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.03 
 
 
480 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  46.36 
 
 
482 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  46.23 
 
 
480 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.91 
 
 
493 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.84 
 
 
485 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.54 
 
 
489 aa  363  3e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.51 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  44.91 
 
 
489 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.09 
 
 
485 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  42.6 
 
 
501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  42.51 
 
 
485 aa  343  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  41.26 
 
 
503 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.5 
 
 
481 aa  329  7e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  41.48 
 
 
490 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.67 
 
 
490 aa  317  4e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  39.44 
 
 
488 aa  316  8e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.32 
 
 
484 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.12 
 
 
487 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  38.28 
 
 
482 aa  295  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  39 
 
 
488 aa  293  5e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  37.97 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.69 
 
 
481 aa  280  4e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  37.22 
 
 
486 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 
486 aa  279  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  39.24 
 
 
504 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.03 
 
 
490 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  35.97 
 
 
473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.28 
 
 
458 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 
478 aa  230  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 
472 aa  225  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  31.63 
 
 
471 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  33.93 
 
 
489 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  35.35 
 
 
461 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.35 
 
 
573 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  35.98 
 
 
493 aa  220  5e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  34.39 
 
 
933 aa  219  6e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  32.46 
 
 
972 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  35.19 
 
 
570 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  33.02 
 
 
579 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.33 
 
 
476 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 
470 aa  203  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 
924 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.84 
 
 
487 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.84 
 
 
487 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  35.42 
 
 
577 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  34.02 
 
 
584 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  36.88 
 
 
578 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 
954 aa  188  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  31.39 
 
 
921 aa  186  6e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 
547 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  30.4 
 
 
646 aa  180  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 
643 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  32.81 
 
 
640 aa  171  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  29.49 
 
 
610 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 
636 aa  166  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  32.29 
 
 
630 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  32.26 
 
 
611 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.11 
 
 
574 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  29.02 
 
 
557 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  32.47 
 
 
771 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  31.36 
 
 
626 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.74 
 
 
645 aa  159  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 
619 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 
618 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  34.45 
 
 
800 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 
767 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 
630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 
586 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  28.31 
 
 
557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 
533 aa  153  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  32.03 
 
 
760 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 
765 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 
765 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 
761 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  31.73 
 
 
619 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 
632 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  30.15 
 
 
641 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.28 
 
 
629 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  30.17 
 
 
701 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 
597 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.3 
 
 
646 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 
766 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 
646 aa  150  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 
673 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 
764 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  32.1 
 
 
756 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>