36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0349 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0349  penicillin-binding protein  100 
 
 		 540 aa  1073    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4485  NTF2 domain protein transpeptidase  36.33 
 
 		 559 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.4 
 
 		 593 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.89 
 
 		 585 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.68 
 
 		 586 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.68 
 
 		 586 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.68 
 
 		 586 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  25.77 
 
 		 608 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  28.83 
 
 		 580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.54 
 
 		 606 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  25.8 
 
 		 599 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.54 
 
 		 606 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.54 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.04 
 
 		 588 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  23.91 
 
 		 603 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  23.73 
 
 		 604 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  25.47 
 
 		 619 aa  94.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  23.88 
 
 		 644 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  25.59 
 
 		 612 aa  90.9  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  25.4 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.4 
 
 		 664 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  23.67 
 
 		 625 aa  65.1  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  24.03 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  24.3 
 
 		 662 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  22.73 
 
 		 627 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  29.47 
 
 		 531 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  28.42 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  26.97 
 
 		 636 aa  57.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  25.85 
 
 		 543 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  24.34 
 
 		 643 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  24.71 
 
 		 507 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  22.4 
 
 		 689 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  27.78 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  21.43 
 
 		 649 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.15 
 
 		 639 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  30.6 
 
 		 661 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>