More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2475 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 643 aa  1287    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  52.9 
 
 		 689 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  38.08 
 
 		 643 aa  364  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  38.08 
 
 		 627 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  36.71 
 
 		 630 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  34.64 
 
 		 619 aa  257  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  34.83 
 
 		 633 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 		 625 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  31.76 
 
 		 659 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.13 
 
 		 606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  32.36 
 
 		 599 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.97 
 
 		 590 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.97 
 
 		 606 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  30.58 
 
 		 603 aa  189  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.97 
 
 		 664 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  33.94 
 
 		 661 aa  182  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.42 
 
 		 636 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  34.72 
 
 		 678 aa  181  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  37.85 
 
 		 689 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.86 
 
 		 588 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  29.93 
 
 		 662 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  33.91 
 
 		 543 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  32.02 
 
 		 649 aa  169  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.7 
 
 		 604 aa  168  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.01 
 
 		 639 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  29.6 
 
 		 608 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  36.62 
 
 		 507 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.69 
 
 		 645 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.76 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  37.79 
 
 		 540 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  33.58 
 
 		 826 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  28.54 
 
 		 580 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.12 
 
 		 563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.11 
 
 		 512 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.9 
 
 		 586 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.9 
 
 		 586 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.9 
 
 		 586 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  27.47 
 
 		 612 aa  130  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  25.73 
 
 		 640 aa  127  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.17 
 
 		 585 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.77 
 
 		 593 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  35.09 
 
 		 644 aa  117  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  25.92 
 
 		 645 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  25.56 
 
 		 639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  25.69 
 
 		 647 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  24.79 
 
 		 596 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  23.46 
 
 		 610 aa  112  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  24.83 
 
 		 636 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  24.77 
 
 		 642 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  24.42 
 
 		 648 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  24.42 
 
 		 648 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  26.53 
 
 		 615 aa  107  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  33.56 
 
 		 417 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  23.69 
 
 		 645 aa  104  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.36 
 
 		 643 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  25.89 
 
 		 648 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  24.55 
 
 		 605 aa  103  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  34.98 
 
 		 531 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  24 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  25.56 
 
 		 648 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  25.11 
 
 		 609 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  35.45 
 
 		 570 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  32.51 
 
 		 573 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  26.5 
 
 		 658 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  26.77 
 
 		 603 aa  100  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  26 
 
 		 647 aa  100  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  24.28 
 
 		 691 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  25.41 
 
 		 636 aa  98.6  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  25.87 
 
 		 535 aa  98.2  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0443  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.17 
 
 		 673 aa  97.8  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  29.18 
 
 		 489 aa  97.8  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  25.63 
 
 		 619 aa  97.4  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2826  penicillin-binding protein 3  22.7 
 
 		 655 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  24.77 
 
 		 611 aa  97.1  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  25.26 
 
 		 630 aa  97.1  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  23.12 
 
 		 703 aa  96.3  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2498  penicillin-binding protein 3  22.16 
 
 		 655 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  24.03 
 
 		 775 aa  96.3  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  24.11 
 
 		 673 aa  94.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0050  peptidoglycan glycosyltransferase  23.74 
 
 		 595 aa  94.7  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  24.06 
 
 		 689 aa  94.7  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  24.56 
 
 		 605 aa  94.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.09 
 
 		 490 aa  94  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  24.58 
 
 		 634 aa  94  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  24.4 
 
 		 681 aa  94  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  26.09 
 
 		 636 aa  94  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  22.1 
 
 		 609 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  26.64 
 
 		 711 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  21.75 
 
 		 646 aa  93.2  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  24.84 
 
 		 646 aa  93.2  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  24.81 
 
 		 612 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  24.81 
 
 		 612 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  24.51 
 
 		 740 aa  92.8  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  23.82 
 
 		 613 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  24.53 
 
 		 615 aa  91.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  23.27 
 
 		 574 aa  92  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 		 480 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  21.96 
 
 		 610 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3451  penicillin-binding protein 2  26.5 
 
 		 691 aa  91.7  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  22.1 
 
 		 609 aa  90.5  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>