More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6659 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
417 aa  830    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  50.64 
 
 
570 aa  252  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  46.33 
 
 
573 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  42.95 
 
 
590 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  36.86 
 
 
543 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.22 
 
 
639 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  33.88 
 
 
512 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.01 
 
 
507 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  38.41 
 
 
540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  37.72 
 
 
659 aa  129  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
636 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  35.05 
 
 
826 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.33 
 
 
664 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.71 
 
 
606 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  32.8 
 
 
689 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  34.34 
 
 
603 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  33.96 
 
 
608 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  33.88 
 
 
662 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.03 
 
 
588 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  34.14 
 
 
661 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  33.23 
 
 
619 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  34.75 
 
 
608 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.7 
 
 
563 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.14 
 
 
590 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.14 
 
 
606 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.98 
 
 
645 aa  110  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  33.99 
 
 
599 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.35 
 
 
604 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  32.22 
 
 
495 aa  106  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.86 
 
 
593 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  34.73 
 
 
649 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  30.72 
 
 
643 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  32.53 
 
 
531 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  32.29 
 
 
580 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  34.42 
 
 
612 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  31 
 
 
488 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.41 
 
 
585 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.92 
 
 
586 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.92 
 
 
586 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.92 
 
 
586 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 
485 aa  94  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  31.4 
 
 
480 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  28.9 
 
 
487 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  29.1 
 
 
487 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.73 
 
 
489 aa  88.2  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 
625 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.29 
 
 
643 aa  87.8  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  31.89 
 
 
644 aa  87.8  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  30.75 
 
 
482 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  28.7 
 
 
972 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 
491 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 
491 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 
491 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.28 
 
 
485 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  30.53 
 
 
627 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.45 
 
 
472 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  32.13 
 
 
633 aa  80.1  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  27.89 
 
 
485 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  32.98 
 
 
678 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.02 
 
 
491 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  30.14 
 
 
689 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.62 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.88 
 
 
493 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  29.51 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 
487 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 
504 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  30.21 
 
 
493 aa  75.5  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2368  penicillin-binding protein transpeptidase  30 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0864167  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.19 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 
501 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 
578 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  27.91 
 
 
488 aa  73.6  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  27.88 
 
 
504 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.77 
 
 
481 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  28.77 
 
 
489 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  28.66 
 
 
577 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  27.04 
 
 
597 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  28.91 
 
 
630 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.61 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.25 
 
 
458 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  26.67 
 
 
647 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  28.83 
 
 
560 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4043  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.78 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  28.65 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.48 
 
 
573 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.91 
 
 
484 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  27.09 
 
 
603 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  24.93 
 
 
470 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  24.59 
 
 
557 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  27.83 
 
 
473 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  26.32 
 
 
610 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.79 
 
 
488 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  27.2 
 
 
489 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  23.72 
 
 
657 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 
503 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  23.43 
 
 
557 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.3 
 
 
481 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  26.28 
 
 
570 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>