More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5886 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 599 aa  1192    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  42.31 
 
 		 606 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  42.3 
 
 		 604 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.04 
 
 		 588 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  41.13 
 
 		 603 aa  395  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  42.31 
 
 		 590 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  42.31 
 
 		 606 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  40.07 
 
 		 644 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  39.19 
 
 		 608 aa  365  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.05 
 
 		 586 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.05 
 
 		 586 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.05 
 
 		 586 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.02 
 
 		 593 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  42.63 
 
 		 585 aa  340  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  37.99 
 
 		 612 aa  317  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  39.71 
 
 		 580 aa  316  7e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  37.68 
 
 		 633 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.15 
 
 		 625 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  35.7 
 
 		 619 aa  233  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  35.27 
 
 		 540 aa  198  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.2 
 
 		 643 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  43.69 
 
 		 608 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  29.72 
 
 		 643 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  29.64 
 
 		 543 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  39.13 
 
 		 507 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  30.62 
 
 		 661 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  33.45 
 
 		 659 aa  178  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  33.66 
 
 		 678 aa  175  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  32.26 
 
 		 649 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.95 
 
 		 645 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  42.02 
 
 		 512 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  30.26 
 
 		 689 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  29.73 
 
 		 627 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.54 
 
 		 563 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  29.23 
 
 		 662 aa  160  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.62 
 
 		 664 aa  158  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.67 
 
 		 636 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  29.31 
 
 		 630 aa  156  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  39.43 
 
 		 531 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.27 
 
 		 639 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  29.96 
 
 		 689 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  29.59 
 
 		 826 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 485 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0349  penicillin-binding protein  26.22 
 
 		 540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.12 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.37 
 
 		 822 aa  116  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  35.08 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 		 458 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  26.92 
 
 		 647 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  34.52 
 
 		 570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  34.18 
 
 		 573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  29.03 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 		 535 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.56 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  27.63 
 
 		 603 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  27.81 
 
 		 560 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.75 
 
 		 483 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 		 473 aa  105  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.38 
 
 		 704 aa  104  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  35.19 
 
 		 485 aa  104  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 		 489 aa  103  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 		 480 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  31.72 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.21 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  24.58 
 
 		 648 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 		 597 aa  100  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  29.89 
 
 		 487 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.31 
 
 		 487 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  27.31 
 
 		 624 aa  100  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  34.47 
 
 		 470 aa  99.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  30.59 
 
 		 972 aa  98.6  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 		 501 aa  97.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 		 472 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  26.32 
 
 		 586 aa  95.1  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  29.1 
 
 		 586 aa  95.1  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2826  penicillin-binding protein 3  20.7 
 
 		 655 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  24.34 
 
 		 630 aa  94  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 		 490 aa  93.6  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  24.59 
 
 		 639 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  28.65 
 
 		 619 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  26.21 
 
 		 649 aa  93.6  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2498  penicillin-binding protein 3  20.86 
 
 		 655 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 		 485 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  30.98 
 
 		 590 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.87 
 
 		 484 aa  93.6  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.7 
 
 		 478 aa  93.2  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4485  NTF2 domain protein transpeptidase  24.11 
 
 		 559 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  26.2 
 
 		 648 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.32 
 
 		 490 aa  92  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  24.28 
 
 		 640 aa  92  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  26.2 
 
 		 648 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.6 
 
 		 476 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.9 
 
 		 504 aa  91.3  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  29.38 
 
 		 488 aa  91.3  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.34 
 
 		 486 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2221  penicillin-binding protein 3  22.53 
 
 		 661 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00242094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2321  penicillin-binding protein transpeptidase  21.81 
 
 		 642 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  27.17 
 
 		 660 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  37.71 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>